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Enregistrement W3118774180 · doi:10.1002/mgg3.1574

Palmoplantar keratoderma with deafness phenotypic variability in a patient with an inherited <i>GJB2</i> frameshift variant and novel missense variant

2021· article· en· W3118774180 sur OpenAlexaff
Emma Bedoukian, Stefan Rentas, Cara Skraban, Qing Shao, James R. Treat, Dale W. Laird, Kathleen E. Sullivan

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationFrameshift mutationBiologyGeneticsEpidermolysis bullosa simplexGenodermatosisHearing lossPalmoplantar keratodermaPhenotypeMutant proteinMutantHyperkeratosisMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Variants in the GJB2 gene encoding the gap junction protein connexin-26 (Cx26) can cause autosomal recessive nonsyndromic hearing loss or a variety of phenotypically variable autosomal dominant disorders that effect skin and hearing, such as palmoplantar keratoderma (PPK) with deafness and keratitis-ichthyosis-deafness (KID) syndrome. Here, we report a patient with chronic mucocutaneous candidiasis, hyperkeratosis with resorption of the finger tips, profound bilateral sensorineural hearing loss, and normal hair and ocular examination. Exome analysis identified a novel missense variant in GJB2 (NM_004004.5:c.101T>A, p.Met34Lys) that was inherited from a mosaic unaffected parent in the setting of a well-reported GJB2 loss of function variant (NM_004004.5:c.35delG, p.Gly12Valfs*2) on the other allele. METHOD: Rat epidermal keratinocytes were transfected with cDNA encoding wildtype Cx26 and/or the Met34Lys mutant of Cx26. Fixed cells were immunolabeled in order to assess the subcellular location of the Cx26 mutant and cell images were captured. RESULTS: Expression in rat epidermal keratinocytes revealed that the Met34Lys mutant was retained in the endoplasmic reticulum, unlike wildtype Cx26, and failed to reach the plasma membrane to form gap junctions. Additionally, the Met34Lys mutant acted dominantly to wildtype Cx26, restricting its delivery to the cell surface. CONCLUSION: Overall, we show the p.Met34Lys variant is a novel dominant acting variant causing PPK with deafness. The presence of a loss a function variant on the other allele creates a more severe clinical phenotype, with some features reminiscent of KID syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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