Bacterial topography of the bovine respiratory tract
Notice bibliographique
Résumé
It is generally accepted that the nasopharynx is the primary source of bovine respiratory disease (BRD) pathogens for the lower respiratory tract (LRT) of cattle. Indeed, it has long been held that the nasopharynx plays a causative role in the development of BRD. However, it has been shown that there is poor agreement between the microbiota of the nasopharynx and the LRT in cattle. Conflicting results from recent studies suggest that BRD pathogens in the nasopharynx may not always significantly differ between healthy cattle and those diagnosed with BRD. These observations make sense in light of recent research in human medicine, which suggests that bacterial pathogens that cause lung infections don’t originate from the nasopharynx and that the nasopharyngeal microbiota contribute very little to composition of lung microbiota. There was surprisingly more similarity between the mouth/oropharyngeal microbiotas and the lung microbiota. In the pursuit of finding alternative strategies for controlling BRD at the feedlot such as probiotics or local antimicrobials, it is crucial to understand which upper respiratory tract (URT) microbiotas contribute the most to the LRT microbiotas so that we can modulate the correct bacterial communities. Therefore, the objective of this study is to map the bacterial microbiotas present along the entire beef cattle respiratory tract and determine the relative contributions of these communities to the microbiota of the lung.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».