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Enregistrement W3118820211 · doi:10.21203/rs.2.21174/v1

Potential mechanisms of quantitative resistance to Leptosphaeria maculans (blackleg) on cotyledons of canola (Brassica napus)

2020· preprint· en· W3118820211 sur OpenAlexaffabout
Michelle Hubbard, Chun Zhai, Gary Peng

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeptosphaeria maculansBlacklegCanolaBrassicaResistance (ecology)BiologyAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<title>Abstract</title> <bold>Background: </bold>Blackleg disease, caused by <italic>Leptosphaeria maculans</italic> (<italic>Lm</italic>), can lead to significant losses of canola/rapeseed crops. Growing resistant canola cultivars can be an effective and environmentally friendly way to manage blackleg. Major resistance genes may stop infection, but can also be rapidly overcome by shifts in pathogen population towards virulence. Thus, using race-nonspecific or quantitative resistance (QR) is of interest because it is potentially more durable. However, the mechanisms and genes underlying QR are mostly unknown. In this study, we explored QR in “74‑44 BL”, a Canadian canola cultivar carrying a moderate level of race nonspecific resistance, based on cotyledon inoculation (Supple. Fig.1) . The susceptible cultivar “Westar” was used as a control. Lesions developed more slowly on 74-44BL than on Westar. We used RNA-Seq to identify genes and gene functions putatively involved in the QR. <bold>Results:</bold> Relative to inoculated Westar, some of the <italic>B. napus</italic> genes that were differentially expressed strongly in inoculated 74-44 BL included those putatively involved in programmed cell death (PCD), reactive oxygen species (ROS) generation, signal transduction and/or intracellular endomembrane transport. Examples included genes annotated as a Bax inhibitor 1, a development/cell death (DCD) domain containing proteinases and peptidases, all of which could play a role in PCD and a zinc-finger Sec23/Sec24 and five small GTPases likely involved in endoplasmic reticulum (ER) to Golgi vesicle traffic and/or signal transduction. Further experiments, however, did not confirm changes in genomic DNA degradation, a potential marker for PCD, between the two cultivars. In addition, infection progression in cotyledons was not altered by applying protease inhibitors directly to cotyledons. Additional testing was done using green fluorescent protein (GFP)-tagged <italic>Lm </italic>for cotyledon colonization as well as ROS production, in relation to the lesion development. The results showed that ROS production occurred beyond the area colonized by <italic>Lm</italic> hyphae in 74-44 BL.<bold>Conclusions: </bold>ROS may also be involved in signal transduction and/or intracellular endomembrane transport. These results provide a starting point for a better understanding of the mechanisms behind QR against <italic>Lm</italic> in canola and developing new host-resistance strategies for management of blackleg.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,621

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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