MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3119209334 · doi:10.1101/cshperspect.a039958

Of Cells, Strands, and Networks: Auxin and the Patterned Formation of the Vascular System

2021· review· en· W3119209334 sur OpenAlexafffund
Dhruv Lavania, Nguyễn Mạnh Linh, Enrico Scarpella

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Perspectives in Biology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyAuxinCell biologyPopulationProcess (computing)Vascular tissueCellNeuroscienceCell divisionDirectionalityAnatomyBotanyComputer scienceBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Throughout plant development, vascular cells continually form from within a population of seemingly equivalent cells.Vascular cells connect end to end to form continuous strands, and vascular strands connect at both or either end to form networks of exquisite complexity and mesmerizing beauty.Here we argue that experimental evidence gained over the past few decades implicates the plant hormone auxin-its production, transport, perception, and response-in all the steps that lead to the patterned formation of the plant vascular system, from the formation of vascular cells to their connection into vascular networks.We emphasize the organizing principles of the cell-and tissue-patterning process, rather than its molecular subtleties.In the picture that emerges, cells compete for an auxin-dependent, cellpolarizing signal; positive feedback between cell polarization and cell-to-cell movement of the polarizing signal leads to gradual selection of cell files; and selected cell files differentiate into vascular strands that drain the polarizing signal from the neighboring cells.Although the logic of the patterning process has become increasingly clear, the molecular details remain blurry; the future challenge will be to bring them into razor-sharp focus. AUXIN AND THE PLANT VASCULAR SYSTEMI n most multicellular organisms, water, nutri- ents, and signals are transported by tissue networks.In animals, this essential transport function is distributed over separate tissue networks-for example, the nervous, circulatory, and respiratory systems.By contrast, in plants, all transport functions are performed by the only tissue network: the vascular system.The plant vascular system is a network of vascular strands that connect the different parts of an organ and the different organs of a plant (Fig. 1; Esau 1965).Vascular strands are bundles of files of vascular cells that are elongated along the file and connected at their ends (Fig. 1).Vascular strands are named differently in different organs: veins in flat organs like leaves, petals, sepals, and cotyledons; vascular bundles in the stem; and vascular cylinder or stele in the root.The relation between the plant hormone auxin and vascular development is old (e.g., Kraus et al. 1936) and varied (e.g., Snow 1935;Camus 1949;Jacobs 1952;Wangermann 1967).Here we discuss evidence that suggests that auxin controls the patterned formation of the vascular system at all the system's organization levels: the cells', the strands', and the network's.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,005
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCold Spring Harbor Perspectives in BiologyMême sujetPlant Molecular Biology ResearchTravaux en français237 207