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Enregistrement W3119330418 · doi:10.30574/gscbps.2021.14.1.0002

In-silico investigation of curcumin drug-likeness, gene-targets and prognostic relevance of the targets in panels of human cancer cohorts

2021· article· en· W3119330418 sur OpenAlexaff
David B Oshevire, Aishatu Mustapha, Blessing U. Alozieuwa, Hassana H. Badeggi, Abdulfatai Ismail, Opeyemi N. Hassan, Peter I Ugwunnaji, Jonathan Ibrahim, Bashir Lawal, Eustace B. Berinyu

Notice bibliographique

RevueGSC Biological and Pharmaceutical Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensInternational Development Research Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCurcuminDruggabilityIn silicoCancerPharmacologyDrugComputational biologyDrug discoveryBiologyIn vivoDrug resistancePTENBioinformaticsGeneMedicinePI3K/AKT/mTOR pathwayBiotechnologyGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite advancements in diagnostic and standard treatment modalities, cancer survival rate remains disappointing globally. It has however, been recognized that exploring the therapeutic properties of secondary metabolite from natural products may alleviate the problems of drug resistance and toxicity that besiege the conventional therapies, and hence improve the overall prognosis of cancer patient. To this end curcumin, a polyphenolic natural compound has been widely studied for it anticancer activities in in vitro and in vivo models. Computational technology has significantly improved the success rate of drug discovery and development, hence, it has become a widely explore tool in drug candidate identification. In this study we used computational approached to identify 12 genes that are potential druggable candidate for curcumin. The genes identified were found to be enriched in cancer and drug resistance associated signaling pathways. Interestingly, the top 3 identified genes; Microtubule-associated protein tau (MAPT), Toll-like receptor 9 (TLR9) and Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1) were observed to be over expressed in multiple cancer cohorts and were associated with poor prognoses of the patients. Curcumin has good physicochemical, bioavailability and ADMET properties. Importantly, it met the Lipinski's Rule of 5 for drug likeness and thus worthy of further in vitro and in vivo confirmation studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,452

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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