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Enregistrement W3119363889 · doi:10.1186/s12935-021-01898-9

Morphological and molecular characteristics of spheroid formation in HT-29 and Caco-2 colorectal cancer cell lines

2021· article· en· W3119363889 sur OpenAlexaff
Elmira Gheytanchi, Marzieh Naseri, Feridoun Karimi‐Busheri, Fatemeh Atyabi, Ensie Sadat Mirsharif, Mahmood Bozorgmehr, Roya Ghods, Zahra Madjd

Notice bibliographique

RevueCancer Cell International · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesIran University of Medical Sciences
Mots-clésHomeobox protein NANOGSOX2KLF4Cancer stem cellCD44SpheroidColorectal cancerLIN28Stem cell markerVimentinCancer researchMetastasisPopulationFlow cytometryBiologyBMI1CancerCell cultureStem cellCellMolecular biologyEmbryonic stem cellCell biologyMedicineImmunologyGeneticsGeneImmunohistochemistryInduced pluripotent stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Relapse and metastasis in colorectal cancer (CRC) are often attributed to cancer stem-like cells (CSCs), as small sub-population of tumor cells with ability of drug resistance. Accordingly, development of appropriate models to investigate CSCs biology and establishment of effective therapeutic strategies is warranted. Hence, we aimed to assess the capability of two widely used and important colorectal cancer cell lines, HT-29 and Caco-2, in generating spheroids and their detailed morphological and molecular characteristics. METHODS: CRC spheroids were developed using hanging drop and forced floating in serum-free and non-attachment conditions and their morphological features were evaluated by scanning electron microscopy (SEM). Then, the potential of CSCs enrichment in spheroids was compared to their adherent counterparts by analysis of serial sphere formation capacity, real-time PCR of key stemness genes (KLF4, OCT4, SOX2, NANOG, C-MYC) and the expression of potential CRC-CSCs surface markers (CD166, CD44, and CD133) by flow cytometry. Finally, the expression level of some EMT-related (Vimentin, SNAIL1, TWIST1, N-cadherin, E-cadherin, ZEB1) and multi-drug resistant (ABCB1, ABCC1, ABCG2) genes was evaluated. RESULTS: Although with different morphological features, both cell lines were formed CSCs-enriched spheroids, indicated by ability to serial sphere formation, significant up-regulation of stemness genes, SOX2, C-MYC, NANOG and OCT4 in HT-29 and SOX2, C-MYC and KLF4 in Caco-2 spheroids (p-value < 0.05) and increased expression of CRC-CSC markers compared to parental cells (p-value < 0.05). Additionally, HT-29 spheroids exhibited a significant higher expression of both ABCB1 and ABCG2 (p-value = 0.02). The significant up-regulation of promoting EMT genes, ZEB1, TWIST1, E-cadherin and SNAIL1 in HT-29 spheroids (p-value = 0.03), SNAIL1 and Vimentin in Caco-2 spheroids (p-value < 0.05) and N-cadherin down-regulation in both spheroids were observed. CONCLUSION: Enrichment of CSC-related features in HT-29 and Caco-2 (for the first time without applying special scaffold/biochemical) spheroids, suggests spheroid culture as robust, reproducible, simple and cost-effective model to imitate the complexity of in vivo tumors including self-renewal, drug resistance and invasion for in vitro research of CRC-CSCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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