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Enregistrement W3119416465 · doi:10.21423/aabppro20197303

Investigating the dynamics of Johne’s Disease on Ontario dairy farms

2019· article· en· W3119416465 sur OpenAlexaffabout
Jamie Imada, D.F. Kelton, S.M. Roche, C.A. Bauman

Notice bibliographique

RevueAmerican Association of Bovine Practitioners Conference Proceedings · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCullingParatuberculosisMycobacterium avium subspecies paratuberculosisHerdDairy cattleDisease controlDiseaseVeterinary medicineRisk assessmentAgricultural scienceMycobacterium avium subsp. paratuberculosisMedicineEnvironmental healthAnimal scienceBiologyMycobacteriumTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Johne’s disease (JD) is an untreatable disease of ruminants caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis. The long latent period and variable manifestation in clinical presentation poses some significant challenges in its detection and control on farms. JD results in economic losses from early culling and production loss due to chronic enteric disease. In January 2010, Ontario began a voluntary control program called the Johne’s Education and Management Assistance program. The program consisted of an on-farm risk assessment survey and whole herd testing by either milk or serum ELISA with subsequent permanent removal of any high titre cow. The purpose of the risk assessment surveys or RAMPs (Risk assessment and management plans) were to identify areas on farm that would result in increased risk of acquiring or transmitting JD. After completing the RAMP, the farm would be given a score out of 300; a higher score correlating with a higher risk of JD. The veterinarian would then make a maximum of three recommendations for improvement of facilities or management for JD control. Based on data collected from over 2,000 dairy farms in Ontario from 2010 to 2013, using individual animal ELISA testing of milk or serum, approximately 26% of farms had at least one test positive animal. Through testing of bulk tank (BT) milk from all Ontario farms in 2013, roughly 50% of farms had a positive bulk tank test for Johne’s. There are numerous barriers to the efficacy of extension programs targeting JD control, and the benefit of risk assessment-based programs for a disease such as Johne’s remains unclear. The objectives of the study are to 1) assess changes in herd-level prevalence of JD 2) to describe associations between RAMP score and herd bulk tank test changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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