Recent diversification in the high Andes: unveiling the evolutionary history of the Ecuadorian hillstar,<i>Oreotrochilus chimborazo</i>(Apodiformes: Trochilidae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Studying the genetic signatures of evolutionary diversification in young lineages is among the most promising approaches for unveiling the processes behind speciation. Here, we focus on Oreotrochilus chimborazo, a high Andean species of hummingbird that might have experienced rapid diversification in the recent past. To understand the evolution of this species, we generated a dataset of ten microsatellite markers and complementary data on morphometrics, plumage variation and ecological niches. We applied a series of population and coalescent-based analyses to understand the population structure and differentiation within the species, in addition to the signatures of current and historical gene flow, the location of potential contact zones and the relationships among lineages. We found that O. chimborazo comprises three genetic groups: one corresponding to subspecies O. c. chimborazo, from Chimborazo volcano and surroundings, and two corresponding to the northern and southern ranges of subspecies O. c. jamesonii, found from the extreme south of Colombia to southern Ecuador. We inferred modest levels of both contemporary and historical gene flow and proposed the location of a contact zone between lineages. Also, our coalescent-based analyses supported a rapid split among these three lineages during the mid-to-late Holocene. We discuss our results in the light of past and present potential distributions of the species, in addition to evolutionary trends seen in other Andean hummingbirds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».