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Enregistrement W3119496923 · doi:10.1093/biolinnean/blaa200

Recent diversification in the high Andes: unveiling the evolutionary history of the Ecuadorian hillstar,<i>Oreotrochilus chimborazo</i>(Apodiformes: Trochilidae)

2020· article· en· W3119496923 sur OpenAlexaff
Elisa Bonaccorso, Carlos A. Rodríguez‐Saltos, Juan F. Freile, Nicolás Peñafiel, Laura Rosado-Llerena, Nora H. Oleas

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesUniversidad San Francisco de Quito
Mots-clésCoalescent theorySubspeciesBiologyEvolutionary biologyGene flowEcological nichePopulationPhylogeographyEcologyAllopatric speciationHummingbirdBiological dispersalPlumageZoologyPhylogenetic treeGenetic variationHabitatGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Studying the genetic signatures of evolutionary diversification in young lineages is among the most promising approaches for unveiling the processes behind speciation. Here, we focus on Oreotrochilus chimborazo, a high Andean species of hummingbird that might have experienced rapid diversification in the recent past. To understand the evolution of this species, we generated a dataset of ten microsatellite markers and complementary data on morphometrics, plumage variation and ecological niches. We applied a series of population and coalescent-based analyses to understand the population structure and differentiation within the species, in addition to the signatures of current and historical gene flow, the location of potential contact zones and the relationships among lineages. We found that O. chimborazo comprises three genetic groups: one corresponding to subspecies O. c. chimborazo, from Chimborazo volcano and surroundings, and two corresponding to the northern and southern ranges of subspecies O. c. jamesonii, found from the extreme south of Colombia to southern Ecuador. We inferred modest levels of both contemporary and historical gene flow and proposed the location of a contact zone between lineages. Also, our coalescent-based analyses supported a rapid split among these three lineages during the mid-to-late Holocene. We discuss our results in the light of past and present potential distributions of the species, in addition to evolutionary trends seen in other Andean hummingbirds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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