837. Contamination of Hospital Drains by Carbapenemase-Producing Enterobacterales (CPE) in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The hospital water environment is a CPE reservoir, and transmission of CPE from drains to patients is a risk. Methods We cultured sink and shower drains in patient rooms and communal shower rooms that were exposed to inpatients with CPE colonization/infection from October 2007 to December 2017 at 10 hospitals. We compared patient room drain CPE to prior room occupant CPE using Illumina and MinION whole-genome sequencing. Results Three-hundred and ten inpatients exposed 1,209 drains, of which 53 (4%) yielded 62 CPE isolates at 7 (70%) hospitals. Compared to room occupant CPE isolates, drain CPE isolates were more likely Enterobacter spp. (6, 10% vs. 25, 51%, p< 0.0001) or KPC-producers (9, 15% vs. 23, 47%, p=0.0002). Of the 49 CPE isolates in patient room drains, 4 (8%) were linked to a prior room occupant (Table), 24 (49%) had the same carbapenemase as a prior room occupant but isolates/carbapenemase gene-containing plasmids that were unrelated, and 21 (43%) did not share a carbapenemase with a prior room occupant. The 4 drains linked to prior room occupants were likely contaminated by these room occupants, who were CPE-colonized prior to drain exposure. Despite few links between drain and room occupant CPE, there were 10 isolates harbouring related blaNDM-1-containing IncHI2A/HI2-type plasmids in 8 rooms on two units at one hospital. Nine of these were Enterobacter hormaechei ST66 isolates that were 0 to 6 SNVs apart and one was a Klebsiella oxytoca STnovel isolate. Table. Four patient room drain CPE isolates (D1b, D4, D5, D12) and isolates from prior room occupants that they were related to by whole-genome sequencing. Conclusion It was uncommon for drain CPE to be linked to prior patient exposure. This suggests contamination of most drains by undetected colonized patients and a need for more aggressive patient screening in our hospitals. This may also suggest retrograde (drain-to-drain) transmission, especially considering the 10 isolate drain cluster at one hospital. Reasons for the preponderance of Enterobacter spp. in drains requires further study. Disclosures Allison McGeer, MD, FRCPC, GlaxoSmithKline (Advisor or Review Panel member, Research Grant or Support)Merck (Advisor or Review Panel member, Research Grant or Support)Pfizer (Research Grant or Support)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».