MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3119532129 · doi:10.1101/365825

Extracellular histones, a new class of inhibitory molecules of CNS axonal regeneration

2018· preprint· en· W3119532129 sur OpenAlexaff
Mustafa M. Siddiq, Sari S. Hannila, Yana Zorina, Elena Nikulina, Vera Rabinovich, Jianwei Hou, Rumana Huq, Erica L. Richman, Rosa E. Tolentino, Jens Hansen, Adam Velenosi, Brian K. Kwon, Stella E. Tsirka, Ian Maze, Robert Sebra, Marie T. Filbin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNerve injury and regeneration
Établissements canadiensInternational Collaboration On Repair DiscoveriesPraxis Spinal Cord Institute
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésRegeneration (biology)ExtracellularCell biologyHistoneNeuriteMyelinBiologyChemistryNeuroscienceCentral nervous systemIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Axonal regeneration in the mature CNS is limited by extracellular inhibitory factors. Triple knockout mice lacking the major myelin-associated inhibitors do not display spontaneous regeneration after injury, indicating the presence of other inhibitors. Searching for such inhibitors we have detected elevated levels of histone H3 in human cerebrospinal fluid (CSF) 24 hours after spinal cord injury. Following dorsal column lesions in mice and optic nerve crushes in rats, elevated levels of extracellular histone H3 were detected at the injury site. Similar to myelin-associated inhibitors, these extracellular histones induced growth cone collapse and inhibited neurite outgrowth. Histones mediate inhibition through the transcription factor YB-1 and Toll-like receptor 2, and these effects are independent of the Nogo receptor. Histone-mediated inhibition can be reversed by the addition of activated protein C (APC) in vitro , and APC treatment promotes axonal regeneration in the crushed optic nerve in vivo . These findings identify extracellular histones as a new class of nerve regeneration-inhibiting molecules within the injured CNS. One sentence summary Proteins typically associated with chromatin structure play an unexpected role in limiting axonal regeneration after injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetNerve injury and regeneration→Travaux en français237 207→