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Enregistrement W3119596375 · doi:10.21203/rs.3.rs-138956/v1

Colchicine-Enabled Genomic Doubling In Oil Palm (Elaeis Guineensis Jacq.)

2021· preprint· en· W3119596375 sur OpenAlexaff
W. Nunekpeku, Daniel Nyadanu, Richard Akromah, H. M. Amoatey, Alexander Wireko Kena, Abdelbagi Mukhtar Ali-Ghanim, Daniel Agyei-Dwarko, King Manteaw Odoi, K. E. Danso

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueOil Palm Production and Sustainability
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesInternational Atomic Energy Agency
Mots-clésElaeis guineensisPalm oilColchicineBiologyPalmBotanyHorticultureTraditional medicineAgroforestryMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The African oil palm ( Elaeis guineensis. Jacq. ) is an oleaginous tree belonging to the family Arecaceae . The crop is naturally a diploid species (2n = 2x = 32) and the most important oil bearing perennial tree crop cultivated in tropics. In spite of its huge economic importance, it has a very narrow genetic base making its improvement using conventional techniques very difficult. All commercial planting materials are hybrids derived from heterozygous pisifera and dura parents. The imperativeness of generating adequate novel materials with sufficient genetic diversity in order to increase progress in oil palm improvement is therefore, very essential. Genomic manipulations through chromosome doubling may present opportunities to broaden the genetic base and increase the diversity within the commercial oil palm species. Developing an efficient genome doubling protocols using anti-mitotic agents is very important in this respect. It will also complement haploid/doubled haploid production efforts by enabling successful deployment of doubled haploids in oil palm breeding programmes. The objectives of this study were, therefore, to optimize genomic doubling in oil palm by determining optimum colchicine concentrations and also outline procedures for screening for putative polyploids. Oil palm seedlings were subjected to colchicine treatment at concentrations of 0, 1.26, 3.76, 6.26 and 8.76 mM for 0, 3, 6, 12 or 24 hours. The colchicine treatment produced variable physio-morphologies in the treated seedlings. Principal component analysis and agglomerative hierarchical clustering of genotype dependent treatments were carried out to provide an ordination guide. The response of oil palm seedlings to colchicine treatment showed genotypic, concentration of colchicine applied and treatment duration dependency. Ploidy level analysis of the colchicine treated seedlings revealed that polyploidization in oil palm increased significantly (p ≤ 0.05) with increasing colchicine concentration. Seedlings of the genotype G-131 responded more favourably to the colchicine treatment than seedlings of G-132. Optimal colchicine concentration for genome doubling in G-131 (28.9 %) and G-132 (17.8 %) was 8.76 mM applied for a period of 24 h. A population of 154 tetraploids out of 1800 seedlings of the two genotypes mutagenized has been identified and being raised for further evaluation and genetic exploitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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