MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3119630433 · doi:10.1038/s41467-020-20078-3

Structural basis for voltage-sensor trapping of the cardiac sodium channel by a deathstalker scorpion toxin

2021· article· en· W3119630433 sur OpenAlexafffund
Daohua Jiang, Lige Tonggu, Tamer M. Gamal El-Din, Richard Banh, Régis Pomès, Ning Zheng, William A. Catterall

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeWestern Canada Research GridCompute CanadaUniversity of WashingtonNational Institutes of HealthGovernment of CanadaU.S. Department of Health and Human ServicesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésGatingSodium channelScorpion toxinBiophysicsTrappingChemistryToxinIon channelSodiumBiochemistryBiologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Voltage-gated sodium (Na V ) channels initiate action potentials in excitable cells, and their function is altered by potent gating-modifier toxins. The α-toxin LqhIII from the deathstalker scorpion inhibits fast inactivation of cardiac Na V 1.5 channels with IC 50 = 11.4 nM. Here we reveal the structure of LqhIII bound to Na V 1.5 at 3.3 Å resolution by cryo-EM. LqhIII anchors on top of voltage-sensing domain IV, wedged between the S1-S2 and S3-S4 linkers, which traps the gating charges of the S4 segment in a unique intermediate-activated state stabilized by four ion-pairs. This conformational change is propagated inward to weaken binding of the fast inactivation gate and favor opening the activation gate. However, these changes do not permit Na + permeation, revealing why LqhIII slows inactivation of Na V channels but does not open them. Our results provide important insights into the structural basis for gating-modifier toxin binding, voltage-sensor trapping, and fast inactivation of Na V channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil0,289

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207