Changes in the range and virulence of <i>Plasmodiophora brassicae</i> across Canada
Notice bibliographique
Résumé
M.R. Mcdonald1* , F. Al-Daoud1, A. Sedaghatkish1, M. Moran2, T.J. Cranmer3 & B.D. Gossen4 1 Department of Plant Agriculture, University of Guelph, Guelph, ON N1G 2W1, Canada2 Ontario Ministry of Agriculture, Food, and Rural Affairs, Stratford, ON N5A 6S4, Canada3 Ontario Ministry of Agriculture, Food, and Rural Affairs, Guelph, ON N1G 4Y2, Canada4 Agriculture and Agri-Food Canada, Saskatoon Research and Development Centre, Saskatoon, SK S7N 0X2, CanadaCorrespondence to: M.R. McDonald. E-mail: mrmcdona@uoguelph.caAbstractPlasmodiophora brassicae causes clubroot on Brassica vegetables and canola around the world. A diverse assemblage of new pathotypes have been identified on canola in the Canadian province of Alberta since 2012, but the pathotypes present in the rest of Canada have not been assessed in detail in recent years. Brassica vegetable and canola fields in Ontario were surveyed for clubroot in 2017–2019. The pathotype of isolates collected was determined using the Williams differential set. Clubroot samples or soil from six other Canadian provinces were also assessed. Clubroot appears to be spreading on canola in Ontario. Pathotype 6 was found only on vegetables and pathotype 2 was predominant on canola; pathotypes 2X and 3X were also identified on canola. The ‘X’ indicates collections that were virulent on the first generation of clubroot-resistant canola cultivars in Canada. Prior to 2012, the pathotypes in eastern Canada were 1, 2, 3, 4, 5, and 6 and the pathotypes in western Canada were 3, 5, and 8 with 6 found on vegetables in British Columbia. Additional virulent pathotypes 2X, 3X, and 5X were identified in eastern Canada and pathotype 9 was found in Manitoba. Two instances of rapid shifts in pathotype at research sites were demonstrated, one in Ontario (pathotype 6 to 2) and one in Quebec (pathotypes 2 and 5 to 2X and 5X).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».