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Enregistrement W3120080023 · doi:10.1186/s13223-021-00526-5

Interaction between early-life pet exposure and methylation pattern of ADAM33 on allergic rhinitis among children aged 3–6 years in China

2021· article· en· W3120080023 sur OpenAlexvenueno aff
Yu Zhang, Meiyu Tan, Xiaoqiong Qian, Cong Li, Lei Yue, Yuehong Liu, Song Shi

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesShanghai Municipal Health BureauScience and Technology Commission of Shanghai Municipality
Mots-clésCpG siteDNA methylationMethylationEpigeneticsGenePeripheral blood mononuclear cellCohortPromoterBiologyMedicineImmunologyOncologyInternal medicineGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent research has pointed out the important roles of epigenetic modifications in the development and persistence of allergic rhinitis (AR), especially in relation to DNA methylation of disease-associated genes. We investigated whether AR susceptibility genes were epigenetically regulated, and whether methylation modulation of these genes in response to early-life environment could be a molecular mechanism underlying the risk for AR onset in a cohort of children aged 3-6 years in China. METHODS: Peripheral blood mononuclear cell (PBMC) samples were collected from 130 children patients, aged 3-6 years and diagnosed with AR; and 154 matched controls to detect promoter methylation in 25 AR susceptibility genes with the MethylTarget approach. Methylation levels were compared for each CpG site, each amplified region, and each gene. In addition, the relationship among DNA methylation, early-life environmental risk factors and AR onset were assessed. RESULTS: Maternal allergic history (P = 0.0390) and pet exposure (P = 0.0339) were significantly associated with increased AR risk. Differential methylation analyses were successfully performed for 507 CpG sites, 34 amplified regions and 17 genes and significant hypomethylation was observed in the promoter region of ADAM33 in AR patients [multiple test-corrected (FDR) P-value < 0.05]. Spearman correlation analysis revealed that the hypomethylation of ADAM33 was significantly associated with higher eosinophil counts (Spearman's ρ: - 0.187, P-value = 0.037). According to the results of the multiple regression analysis, after adjusting for cofounders, the interaction of early-life pet exposure with methylation level of ADAM33 increased the risk for AR onset 1.423 times more in children (95% CI = 0.0290-4.109, P-value = 0.005). CONCLUSION: This study provides evidence that early-life pet exposure and low methylation level of ADAM33 increase AR risk in children, and the interaction between pet exposure and methylation level of ADAM33 may play an important role in the development of AR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,069

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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