Plasma ctDNA is a tumor tissue surrogate and enables clinical-genomic stratification of metastatic bladder cancer
Notice bibliographique
Résumé
Molecular stratification can improve the management of advanced cancers, but requires relevant tumor samples. Metastatic urothelial carcinoma (mUC) is poised to benefit given a recent expansion of treatment options and its high genomic heterogeneity. We profile minimally-invasive plasma circulating tumor DNA (ctDNA) samples from 104 mUC patients, and compare to same-patient tumor tissue obtained during invasive surgery. Patient ctDNA abundance is independently prognostic for overall survival in patients initiating first-line systemic therapy. Importantly, ctDNA analysis reproduces the somatic driver genome as described from tissue-based cohorts. Furthermore, mutation concordance between ctDNA and matched tumor tissue is 83.4%, enabling benchmarking of proposed clinical biomarkers. While 90% of mutations are identified across serial ctDNA samples, concordance for serial tumor tissue is significantly lower. Overall, our exploratory analysis demonstrates that genomic profiling of ctDNA in mUC is reliable and practical, and mitigates against disease undersampling inherent to studying archival primary tumor foci. We urge the incorporation of cell-free DNA profiling into molecularly-guided clinical trials for mUC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».