Race distribution of <i>Pyrenophora tritici-repentis</i> in relation to ploidy level and susceptibility of durum and winter bread wheat
Notice bibliographique
Résumé
Tan spot is a destructive disease of wheat caused by the fungus Pyrenophora tritici-repentis (Ptr), with most fungal isolates in Canada known to produce the necrotrophic effector (NE) ToxA. In this study, 144 Ptr isolates collected from durum, winter bread wheat, and grasses in western Canada were evaluated for race classification on a host differential set. The susceptibility of 114 durum and winter bread wheat genotypes to Ptr races 2 (R2), 3 (R3), and 5 (R5), producing the NEs ToxA, ToxB, and ToxC, respectively, was evaluated in bioassays. The host genotypes were tested for the presence of Tsn1, the ToxA-sensitivity gene, by PCR analysis. Race composition varied based on the host type and ploidy level from which the isolates were recovered. R1 (ToxA and ToxC-producer) and R2 were predominant on wheat and occurred in equal frequency on durum, while R1 occurred twice as frequently as R2 on winter bread wheat. R3 was recovered only from durum wheat, and the non-pathogenic R4 was the only race recovered from grasses. Susceptibility to R2 and R3 was more common in Canadian than in European wheat, while susceptibility to R5 was more common in durum and European wheat. Tsn1 amplified at a higher percentage in Canadian (51.2% in winter bread, 59.0% in durum) vs. European (20.5%) wheat genotypes. The presence of Tsn1, however, did not result in susceptibility to ToxA-producing isolates in 35.9% of durum genotypes, indicating that other factors are involved in the Ptr-durum interaction and that ToxA-Tsn1 may not play a significant role in tetraploid wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».