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Enregistrement W3120287433 · doi:10.1080/07060661.2020.1870002

Race distribution of <i>Pyrenophora tritici-repentis</i> in relation to ploidy level and susceptibility of durum and winter bread wheat

2021· article· en· W3120287433 sur OpenAlexaffvenueabout
Bohan Wei, T. Despins, M. R. Fernandez, Stephen E. Strelkov, Yuefeng Ruan, R. J. Graf, Reem Aboukhaddour

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPyrenophoraBiologyWinter wheatCommon wheatGenotypeHost (biology)Race (biology)AgronomyCropPoaceaeHorticultureVeterinary medicineGeneCultivarBotanyGeneticsChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tan spot is a destructive disease of wheat caused by the fungus Pyrenophora tritici-repentis (Ptr), with most fungal isolates in Canada known to produce the necrotrophic effector (NE) ToxA. In this study, 144 Ptr isolates collected from durum, winter bread wheat, and grasses in western Canada were evaluated for race classification on a host differential set. The susceptibility of 114 durum and winter bread wheat genotypes to Ptr races 2 (R2), 3 (R3), and 5 (R5), producing the NEs ToxA, ToxB, and ToxC, respectively, was evaluated in bioassays. The host genotypes were tested for the presence of Tsn1, the ToxA-sensitivity gene, by PCR analysis. Race composition varied based on the host type and ploidy level from which the isolates were recovered. R1 (ToxA and ToxC-producer) and R2 were predominant on wheat and occurred in equal frequency on durum, while R1 occurred twice as frequently as R2 on winter bread wheat. R3 was recovered only from durum wheat, and the non-pathogenic R4 was the only race recovered from grasses. Susceptibility to R2 and R3 was more common in Canadian than in European wheat, while susceptibility to R5 was more common in durum and European wheat. Tsn1 amplified at a higher percentage in Canadian (51.2% in winter bread, 59.0% in durum) vs. European (20.5%) wheat genotypes. The presence of Tsn1, however, did not result in susceptibility to ToxA-producing isolates in 35.9% of durum genotypes, indicating that other factors are involved in the Ptr-durum interaction and that ToxA-Tsn1 may not play a significant role in tetraploid wheat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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