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Enregistrement W3120348542 · doi:10.1200/cci.20.00078

Machine Learning Frameworks to Predict Neoadjuvant Chemotherapy Response in Breast Cancer Using Clinical and Pathological Features

2021· article· en· W3120348542 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJCO Clinical Cancer Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreYork UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésReceiver operating characteristicBreast cancerMedicineOncologyLogistic regressionInternal medicinePathologicalNomogramNaive Bayes classifierMachine learningArtificial intelligenceCancerSupport vector machineComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE Neoadjuvant chemotherapy (NAC) is used to treat locally advanced breast cancer (LABC) and high-risk early breast cancer (BC). Pathological complete response (pCR) has prognostic value depending on BC subtype. Rates of pCR, however, can be variable. Predictive modeling is desirable to help identify patients early who may have suboptimal NAC response. Here, we test and compare the predictive performances of machine learning (ML) prediction models to a standard statistical model, using clinical and pathological data. METHODS Clinical and pathological variables were collected in 431 patients, including tumor size, patient demographics, histological characteristics, molecular status, and staging information. A standard multivariable logistic regression (MLR) was developed and compared with five ML models: k-nearest neighbor classifier, random forest (RF) classifier, naive Bayes algorithm, support vector machine, and multilayer perceptron model. Model performances were measured using a receiver operating characteristic (ROC) analysis and statistically compared. RESULTS MLR predictors of NAC response included: estrogen receptor (ER) status, human epidermal growth factor-2 (HER2) status, tumor size, and Nottingham grade. The strongest MLR predictors of pCR included HER2+ versus HER2− BC (odds ratio [OR], 0.13; 95% CI, 0.07 to 0.23; P < .001) and Nottingham grade G3 versus G1-2 (G1-2: OR, 0.36; 95% CI, 0.20 to 0.65; P < .001). The area under the curve (AUC) for the MLR was AUC = 0.64. Among the various ML models, an RF classifier performed best, with an AUC = 0.88, sensitivity of 70.7%, and specificity of 84.6%, and included the following variables: menopausal status, ER status, HER2 status, Nottingham grade, tumor size, nodal status, and presence of inflammatory BC. CONCLUSION Modeling performances varied between standard versus ML classification methods. RF ML classifiers demonstrated the best predictive performance among all models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,358 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle