MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3120520875 · doi:10.3389/fpls.2020.576008

Identification, Gene Structure, and Expression of BnMicEmUP: A Gene Upregulated in Embryogenic Brassica napus Microspores

2021· article· en· W3120520875 sur OpenAlexafffund
Fariba Shahmir, K. Peter Pauls

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMicrosporeCell biologyGeneGene expressionArabidopsisMolecular biologyGeneticsBotanyMutantStamenPollen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microspores ofBrassica napuscan be diverted from normal pollen development into embryogenesis by treating them with a mild heat shock. As microspore embryogenesis closely resembles zygotic embryogenesis, it is used as model for studying the molecular mechanisms controlling embryo formation. A previous study comparing the transcriptomes of three-day-old sorted embryogenic and pollen-like (non-embryogenic) microspores identified a gene homologous toAT1G74730of unknown function that was upregulated 8-fold in the embryogenic cells. In the current study, the gene was isolated and sequenced fromB. napusand namedBnMicEmUP(B. napusmicrospore embryogenesis upregulated gene). Four forms ofBnMicEmUPmRNA and three forms of genomic DNA were identified.BnMicEmUP2,3was upregulated more than 7-fold by day 3 in embryogenic microspore cultures compared to non-induced cultures.BnMicEmUP1,4was highly expressed in leaves. Transient expression studies ofBnMicEmUP3::GFPfusion protein inNicotiana benthamianaand in stableArabidopsistransgenics showed that it accumulates in chloroplasts. The features of the BnMicEmUP protein, which include a chloroplast targeting region, a basic region, and a large region containing 11 complete leucine-rich repeats, suggest that it is similar to a bZIP PEND (plastid envelope DNA-binding protein) protein, a DNA binding protein found in the inner envelope membrane of developing chloroplasts. Here, we report that theBnMicEmUP3overexpression inArabidopsisincreases the sensitivity of seedlings to exogenous abscisic acid (ABA). TheBnMicEmUPproteins appear to be transcription factors that are localized in plastids and are involved in plant responses to biotic and abiotic environmental stresses; as well as the results obtained from this study can be used to improve crop yield.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Plant Science→Même sujetPlant Molecular Biology Research→Travaux en français237 207→