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Enregistrement W3120734760 · doi:10.1029/2020wr028382

DNA Tracer Transport Through Porous Media—The Effect of DNA Length and Adsorption

2021· article· en· W3120734760 sur OpenAlexaboutno aff
Yuran Zhang, Marshall Hartung, Adam J. Hawkins, Anne Dekas, Kewen Li, Roland N. Horne

Notice bibliographique

RevueWater Resources Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueGroundwater flow and contamination studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTRACERDNAAdsorptionPorous mediumBromideChemistryPorosityMaterials scienceChromatographyGeologyGeotechnical engineeringPhysicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Artificial tracer testing is an effective technique to identify fluid flow pathways and characterize subsurface hydrological properties. Synthetic DNA tracers, available in virtually unlimited number of unique variations, enable multiwell tracer testing and have the potential to improve the characterization of groundwater flowpaths enormously. This study investigated the effect of DNA length (i.e., number of base pairs) and adsorption on DNA tracer transport via well‐controlled laboratory experiments. Nine unique synthetic double‐stranded DNA tracers were designed with varying lengths (90–200 base pairs) and flowed with reference solute tracers (bromide and lithium) through columns packed with glass beads or Ottawa sand. The peak arrivals of DNA tracers were earlier than bromide in the glass‐bead column test, yet significantly retarded in the sand column test. In a given porous medium, DNA length did not have noticeable effects on peak arrival or tracer dispersion. However, DNA tracer recovery increased with increasing DNA length in the glass‐bead column test but decreased with increasing DNA length in the sand column test, likely resulting from the corresponding trends in partition coefficients as revealed by tracer transport modeling. Such reversed trends in different porous media likely resulted from the different likelihoods for longer DNA to have multisegment attachment during transport. Our findings suggest that both DNA length and the surface properties of the porous medium have notable effects on DNA tracer transport and hence need to be considered carefully in future tracer test designs in terms of site selection, DNA sequence design and data interpretation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,848

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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