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Enregistrement W3120897040 · doi:10.31274/cc-20240624-1227

Response of Brassica napus lines containing all possible combinations of three clubroot resistance genes to infection by Plasmodiophora brassicae

2020· report· en· W3120897040 sur OpenAlexaboutno aff
Chelsea Wetmore

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typereport
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClubrootBrassicaBiologyGeneResistance (ecology)GeneticsAgronomyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Canola (Brassica napus L.) has become a major field crop in Canada. One of the largest threats to canola production is the disease of clubroot caused by the soilborne pathogen Plasmodiophora brassicae. This disease can have devastating effects on canola yield and quality. Long-lived resting spores make this disease difficult to manage with few strategies proving to be effective. Currently, the most effective management tool is the development and deployment of host plant genetic resistance. We studied a double haploid population developed from crossing a male parent containing clubroot resistance genes PH1 and PH2 to a female parent containing clubroot resistance gene PH3. Molecular profiles for each of the three genes in the DH lines was determined. Planned crosses among a subset of the DH lines were then made to obtain 108 F1s with all possible homozygous and heterozygous combinations of PH1, PH2, and PH3.These 108 F1s 27 genotypes were tested in a greenhouse setting against P. brassicae pathotypes 3H, 3A, and 5X to phenotype their clubroot reaction. Disease index was compared between the 27 combinations of PH1, PH2, and PH3 represented within the 108 F1s. Results found evidence of an epistatic effect between PH2 and PH3 that improved disease resistance to a greater extent than was observed when either gene was in single heterozygous form. The results highlight the importance of verifying gene reactions through gene stacking to identify epistatic effects. Utilizing gene stacking could produce more durable and broad-spectrum clubroot resistant canola varieties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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