Response of Brassica napus lines containing all possible combinations of three clubroot resistance genes to infection by Plasmodiophora brassicae
Notice bibliographique
Résumé
Canola (Brassica napus L.) has become a major field crop in Canada. One of the largest threats to canola production is the disease of clubroot caused by the soilborne pathogen Plasmodiophora brassicae. This disease can have devastating effects on canola yield and quality. Long-lived resting spores make this disease difficult to manage with few strategies proving to be effective. Currently, the most effective management tool is the development and deployment of host plant genetic resistance. We studied a double haploid population developed from crossing a male parent containing clubroot resistance genes PH1 and PH2 to a female parent containing clubroot resistance gene PH3. Molecular profiles for each of the three genes in the DH lines was determined. Planned crosses among a subset of the DH lines were then made to obtain 108 F1s with all possible homozygous and heterozygous combinations of PH1, PH2, and PH3.These 108 F1s 27 genotypes were tested in a greenhouse setting against P. brassicae pathotypes 3H, 3A, and 5X to phenotype their clubroot reaction. Disease index was compared between the 27 combinations of PH1, PH2, and PH3 represented within the 108 F1s. Results found evidence of an epistatic effect between PH2 and PH3 that improved disease resistance to a greater extent than was observed when either gene was in single heterozygous form. The results highlight the importance of verifying gene reactions through gene stacking to identify epistatic effects. Utilizing gene stacking could produce more durable and broad-spectrum clubroot resistant canola varieties.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».