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Enregistrement W3120913912

Single Amino Acid Mutations Alter the Excitation and Emission of mCherry Fluorescent Protein

2017· article· en· W3120913912 sur OpenAlex
Casey Tapsay, Alex Proctor, David A. Bird

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensMount Royal University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmCherryFluorophoreGreen fluorescent proteinFluorescenceChemistryBiophysicsMutagenesisAmino acidMutationBiochemistryBiologyGenePhysics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The second-generation fluorescent protein mCherry has an excitation and emission maximum of 587 nm and 610 nm. The discovery of DsRed in Discosoma sp. and the creation of its second-generation variants marked a significant advance in the field of biology due to its use in microscopy. New and improved proteins will increase the diversity of microscopy experiments. The emission of light in mCherry can be attributed to the excitation of electrons held in four amino acids that form a fluorophore: Tyr-67, Gly-68, Arg-95, and Glu-215. The mCherry fluorophore folds via several post-translational modifications which alter the polypeptide backbone to create an imidazolinone ring. In mCherry, an emission red-shift results from protonation of Glu-215 as it shares a hydrogen bond with the nitrogen of the imidazolinone ring. This interaction modifies the distribution of electron density in the fluorophore. The mRFP variant mStrawberry, with an excitation maximum of 574 nm and emission of 596 nm, differs from mCherry by 6 mutations, including M66T and Q213L. These mutations adjacent to the fluorophore contain significant changes in the size, charge and behavior of the amino acids. We expect mutations near the fluorophore to alter the electron distribution controlling the excitation and emission of the fluorophore. In this paper we use site directed mutagenesis to separately induce these mutations into the plasmid bound mCherry protein and express the protein in Rosetta cells. Using a fluorescent spectrophotometer we expect to observe the blue and red shift previously observed after M66T and Q213L mutations in mStrawberry respectively. * Indicates faculty mentor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,236
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle