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Enregistrement W3120978965 · doi:10.1093/mmy/myaa110

CYP51A polymorphisms of<i>Aspergillus fumigatus</i>in lung transplant recipients: Prevalence, correlation with phenotype, and impact on outcomes

2021· article· en· W3120978965 sur OpenAlexaff
Benoît Henry, Alexis Guenette, Faiqa Cheema, Armelle Pérez-Cortés, Lisa R. McTaggart, Tony Mazzulli, L.G. Singer, Shaf Keshavjee, Julianne V. Kus, Shahid Husain

Notice bibliographique

RevueMedical Mycology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of TorontoPublic Health OntarioUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus fumigatusGenotypingBroth microdilutionGenotypeAspergillusAspergillosisBiologyLungMicrobiologyMedicineImmunologyInternal medicineAntibioticsMinimum inhibitory concentrationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Azole resistance in Aspergillus fumigatus is increasing worldwide and can affect prognosis. It is mostly mediated by cytochrome P51 (CYP51) mutations. In lung transplant recipients (LTR), little is known regarding the prevalence and clinical impact of CYP51 mutations. One hundred thirty-one consecutive A. fumigatus isolates from 103 patients were subjected to CYP51A genotyping through PCR and sequencing. Antifungal susceptibility testing was performed using the Sensititre YeastOne YO-9© broth microdilution technique. Correlations between genotype, phenotype, clinical manifestations of Aspergillus infection, and clinical outcomes were made. Thirty-four (26%) isolates harbored mutations of CYP51A; N248K (n = 14) and A9T (n = 12) were the most frequent. Three isolates displayed multiple point mutations. No significant influences of mutational status were identified regarding azole MICs, the clinical presentation of Aspergillus disease, 1-year all-cause mortality, and clinical outcomes of invasive forms. In the specific context of lung transplant recipients, non-hotspot CYP51A-mutated isolates are regularly encountered; this does not result in major clinical consequences or therapeutic challenges. LAY SUMMARY: In 131 isolates of Aspergillus fumigatus isolates originating from 103 lung transplant recipients, the CYP51A polymorphism rate was 26%, mostly represented by N248K and A9T mutations. These mutations, however, did not significantly impact azoles minimal inhibitory concentrations or clinical outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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