Polygenic Risk Score for Low-Density Lipoprotein Cholesterol Is Associated With Risk of Ischemic Heart Disease and Enriches for Individuals With Familial Hypercholesterolemia
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The clinical implications of a polygenic risk score (PRS) for LDL-C (low-density lipoprotein cholesterol) are not well understood, both within the general population and individuals with familial hypercholesterolemia (FH). METHODS: We developed the LDL-C PRS using Least Absolute Shrinkage and Selection Operator regression in 377 286 White British participants from UK Biobank and tested its association with LDL-C according to FH variant carrier status in another 41 748 whole-exome sequenced individuals. Next, we tested for an enrichment of FH variant carriers among individuals with severe hypercholesterolemia and low LDL-C PRS. Last, we contrasted the effect of the LDL-C PRS, measured LDL-C and FH variant carrier status on risk of ischemic heart disease among 3010 cases and 38 738 controls. RESULTS: Among the 41 748 whole-exome sequenced White British individuals, 1-SD increase in the LDL-C PRS was associated with elevated LDL-C among both FH variant carriers (0.34 [95% CI, 0.22-0.47] mmol/L) and noncarriers (0.42 [95% CI, 0.42-0.43] mmol/L). Among individuals with severe hypercholesterolemia, FH variant carriers were enriched in those with a low LDL-C PRS (odds ratio, 2.20 [95% CI, 1.66-2.71] per SD). Each SD increase in the LDL-C PRS was associated with risk of ischemic heart disease to the comparable magnitude as measured LDL-C (odds ratio, 1.24 [95% CI, 1.20-1.29] and odds ratio, 1.15 [95% CI, 1.09-1.23], respectively). The LDL-C PRS was not strongly associated with other traditional ischemic heart disease risk factors. CONCLUSIONS: An LDL-C PRS could be used to identify individuals with a higher probability of harboring FH variants. The association between ischemic heart disease and the LDL-C PRS was comparable to measured LDL-C, likely because the PRS reflects lifetime exposure to LDL-C levels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».