Pannexin 1 mutation found in melanoma tumor reduces phosphorylation, glycosylation, and trafficking of the channel-forming protein
Notice bibliographique
Résumé
Pannexin 1 (PANX1) is a glycoprotein that forms large pore channels capable of passing ions and metabolites such as ATP for cellular communication. PANX1 has been implicated in many diseases including breast cancer and melanoma, where inhibition or deletion of PANX1 reduced the tumorigenic and metastatic properties of the cancer cells. We interrogated the effect of single amino acid changes in various PANX1 domains using naturally occurring variants reported in cancer patient tumors. We found that a previously reported variant (Q5H) is present in cancer cells, but was not different from the wild type (Q5) in glycosylation, trafficking, or channel function and did not affect cellular properties. We discovered that the Q5H variant is in fact the highly conserved ancestral allele of PANX1 with 89% of humans carrying at least one Q5H allele. Another mutated form Y150F, found in a melanoma patient tumor, prevented phosphorylation at Y150 as well as complex N-glycosylation while increasing intracellular localization. Sarcoma (SRC) is the predicted kinase to phosphorylate the Y150 residue, and its phosphorylation is not likely to be constitutive, but rather dynamically regulated. The Y150 phosphorylation site is the first one reported to play a role in regulating posttranslational modifications and trafficking of PANX1, with potential consequences on its large-pore channel structure and function in melanoma cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».