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Enregistrement W3121135297

Saskatchewan: Isolation of a new Escherichia coli pathotype associated with diarrhea in piglets

2002· article· en· W3121135297 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Musangu Ngeleka

Notice bibliographique

RevueCanadian veterinary journal · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiarrheaEscherichia coliBiologyMicrobiologyFecesAntibioticsPolymerase chain reactionEtiologyVeterinary medicineMedicineGastroenterologyInternal medicineGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diarrhea remains one of the most common diseases of suckling and postweaning piglets worldwide and is responsible for approximately 10.8% of preweaning mortality in certain geographic regions (1). During the last few years, we have observed that in an increasing number of cases suspected of enteric colibacillosis in piglets, it has not proven possible to determine the etiological agent by standard slide agglutination techniques, using anti-fimbrial sera. Our objectives were: (i) To determine the prevalence of E. coli pathotypes among diarrheic and non-diarrheic piglets, using DNA hybridization and polymerase chain reaction (PCR), in order to identify potential emerging diarrhea-causing pathotypes, (ii) to examine the ability of relevant pathotypes to induce diarrhea in newborn pigs, and (iii) to assess an antibiotic sensitivity profile of isolates. Our data showed that approximately 22.9% of E. coli isolates from diarrheic piglets could be attributed to E. coli infection and that 20.5% of these appeared to be associated with ne E. coli, pathotypes AIDA/STb/EAST1 and AIDA/STb. Selected isolates of these pathotypes induced diarrhea in experimentally infected piglets, suggesting a role for the AIDA-I factor in the pathogenesis of diarrhea in piglets. In contrast, the EAST1 pathotype was common among E. coli isolates from both diarrheic and non-diarrheic piglets. An isolate of this pathotype failed to produce diarrhea in piglets, suggesting that EAST1 alone is probably not a significant marker of pathogenic E. coli isolated from piglets with diarrhea. Antibiotic sensitivity testing showed that isolates of the AIDA-I/STb/EAST1 and AIDA-I/STb pathotypes were frequently sensitive to enrofloxacin, gentamicin, neomycin and trimethroprim-sulfamethoxazole, suggesting that these drugs may be useful for treatment of related infections. Enterotoxigenic E. coli (ETEC) has been commonly incriminated as one of the most important etiological agents of the disease, but other groups of E. coli such as Shiga toxin-producing E. coli (STEC) and enteropathogenic E. coli (EPEC) are important enteric pathogens in piglets (reviewed in 2). ETEC strains express F4 (K88), F5 (K99), F6 (987P), F18 or F41 fimbriae and can produce heat labile (LTI and LTII) or heat stable [STa (or STI) and STb (or STII)] enterotoxins. STEC strains, of which enterohemorrhagic E. coli (EHEC) is a subset, express the E. coli attaching and effacing (EAE) factor and produce the shiga-like toxins 1 and 2 (Stx1 and Stx2) associated with hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome in humans. F18 fimbriae-positive strains may produce a shiga-like toxin variant (Stx2e) and are thus referred to as porcine STEC responsible for edema disease or they may produce enterotoxins and are referred to as ETEC causing postweaning diarrhea. EPEC strains produce the EAE adhesin; some of these isolates from humans are further characterized by the expression of “localized adherence (LA)” to Hep-2 cells in vitro. Although many E. coli isolates originally classified as EPEC are EAE- and LA-negative, they exhibit a pattern of diffuse adherence (DA) to Hep-2 cells, distinguishing them as a separate diarrheagenic group known as the diffusely adhering E. coli (DAEC), isolated mainly from diarrheic infants. Isolates of this group express various fimbrial and non-fimbrial adhesins, including the adhesin involved in diffuse adherence (AIDA-I). Although originally detected in E. coli isolates from humans with diarrhea, the AIDA-I system has also been detected recently in E. coli strains isolated from pigs with edema disease and postweaning diarrhea. Another group, the enteroaggregative E. coli (EAggEC), expresses the aggregative adherence fimbriae I (AAF/I) and produces the enteroaggregative heat-stable enterotoxin 1 (EAST1). Strains of the EAggEC have been associated with an episode of persistent diarrhea in children and they exhibit an aggregative adherence pattern to cultured human epithelial cells in vitro. EAST1 has been suggested to play an important role in the pathogenesis of diarrhea in pigs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,945
Score d'incertitude au seuil0,108

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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