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Enregistrement W3121479225 · doi:10.1111/cts.12970

Characterization of CYP3A pharmacogenetic variation in American Indian and Alaska Native communities, targeting<i>CYP3A4*1G</i>allele function

2021· article· en· W3121479225 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueClinical and Translational Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésPharmacogeneticsAlleleBiologyGeneticsFunction (biology)CYP3A4Evolutionary biologyGenotypeGeneCytochrome P450

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The frequencies of genetic variants in the CYP3A4 and CYP3A5 genes differ greatly across global populations, leading to profound differences in the metabolic activity of these enzymes and resulting drug metabolism rates, with important consequences for therapeutic safety and efficacy. Yet, the impact of genetic variants on enzyme activity are incompletely described, particularly in American Indian and Alaska Native (AIAN) populations. To characterize genetic variation in CYP3A4 and CYP3A5 and its effect on enzyme activity, we partnered with AIAN people living in two regions of Alaska: Yup'ik Alaska Native people living in the Yukon-Kuskokwim Delta region of rural southwest Alaska and AIAN people receiving care at the Southcentral Foundation in Anchorage, Alaska. We identified low frequencies of novel and known variation in CYP3A4 and CYP3A5, including low frequencies of the CYP3A4*1G and CYP3A5*1 variants, and linkage disequilibrium patterns that differed from those we previously identified in an American Indian population in western Montana. We also identified increased activity of the CYP3A4*1G allele in vitro and in vivo. We demonstrated that the CYP3A4*1G allele confers increased protein content in human lymphoblastoid cells and both increased protein content and increased activity in human liver microsomes. We confirmed enhanced CYP3A4-mediated 4β-vitamin D hydroxylation activity in Yup'ik people with the CYP3A4*1G allele. AIAN people in Alaska and Montana who carry the CYP3A4*1G allele-coupled with low frequency of the functional CYP3A5*1 variant-may metabolize CYP3A substrates more rapidly than people with the reference CYP3A4 allele.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,553
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle