Phage-Display-Derived Peptide Specific to Carbamylated Protein
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Protein carbamylation has been linked with diseases commonly associated with patients with reduced kidney function. Carbamylated human serum albumin (cHSA), which has been proven to be nephrotoxic and associated with heart failure for chronic kidney disease (CKD) patients, was chosen for our study. Through phage display against cHSA, one specific peptide sequence (cH2-p1) was identified with higher selectivity toward cHSA over native HSA. The cH2-p1 peptide was synthesized, and its target binding was analyzed through isothermal titration calorimetry (ITC). The result showed that cH2-p1 was able to bind cHSA of different levels of carbamylation with a similar dissociation constant of ∼1.0 × 10 –4 M. This peptide also showed a binding specificity to carbamylated fibrinogen (cFgn), while not binding to native Fgn at all. For better understanding of the binding mechanism of cH2-p1, competitive binding of cH2-p1 and anti-homocitrulline to cHSA was performed, and the result revealed that cH2-p1 may bind to homocitrulline residues in a similar manner to the antibody. A molecular docking study was further performed to investigate the favored binding conformation of homocitrulline residue to cH2-p1. This work demonstrates the potential of peptides as a specific binding element to carbamylated proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».