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Enregistrement W3121686920 · doi:10.1186/s13643-021-01583-y

Considerations for conducting systematic reviews: evaluating the performance of different methods for de-duplicating references

2021· article· en· W3121686920 sur OpenAlexaff
Sandra McKeown, Zuhaib M. Mir

Notice bibliographique

RevueSystematic Reviews · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensKingston Health Sciences CentreQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSystematic reviewMedicinePsycINFOFlaggingInformation retrievalComputer scienceMEDLINESet (abstract data type)Data miningDatabaseData science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Systematic reviews involve searching multiple bibliographic databases to identify eligible studies. As this type of evidence synthesis is increasingly pursued, the use of various electronic platforms can help researchers improve the efficiency and quality of their research. We examined the accuracy and efficiency of commonly used electronic methods for flagging and removing duplicate references during this process. METHODS: A heterogeneous sample of references was obtained by conducting a similar topical search in MEDLINE, Embase, Cochrane Central Register of Controlled Trials, and PsycINFO databases. References were de-duplicated via manual abstraction to create a benchmark set. The default settings were then used in Ovid multifile search, EndNote desktop, Mendeley, Zotero, Covidence, and Rayyan to de-duplicate the sample of references independently. Using the benchmark set as reference, the number of false-negative and false-positive duplicate references for each method was identified, and accuracy, sensitivity, and specificity were determined. RESULTS: We found that the most accurate methods for identifying duplicate references were Ovid, Covidence, and Rayyan. Ovid and Covidence possessed the highest specificity for identifying duplicate references, while Rayyan demonstrated the highest sensitivity. CONCLUSION: This study reveals the strengths and weaknesses of commonly used de-duplication methods and provides strategies for improving their performance to avoid unintentionally removing eligible studies and introducing bias into systematic reviews. Along with availability, ease-of-use, functionality, and capability, these findings are important to consider when researchers are selecting database platforms and supporting software programs for conducting systematic reviews.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarecherche
Domaine: Méthodes · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Simulation ou modélisationlow
gptMétarecherche
Domaine: Méthodes · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Autre devishigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,869
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,959
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,8690,959
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,018
Bibliométrie0,0410,039
Études des sciences et des technologies0,0080,014
Communication savante0,0220,024
Science ouverte0,0120,010
Intégrité de la recherche0,0110,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,933
Tête enseignante GPT0,655
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Métarecherche

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation · Autre devis
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations238
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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