A pathogenic UFSP2 variant in an autosomal recessive form of pediatric neurodevelopmental anomalies and epilepsy
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Neurodevelopmental disabilities are common and genetically heterogeneous. We identified a homozygous variant in the gene encoding UFM1-specific peptidase 2 (UFSP2), which participates in the UFMylation pathway of protein modification. UFSP2 variants are implicated in autosomal dominant skeletal dysplasias, but not neurodevelopmental disorders. Homozygosity for the variant occurred in eight children from four South Asian families with neurodevelopmental delay and epilepsy. We describe the clinical consequences of this variant and its effect on UFMylation. METHODS: Exome sequencing was used to detect potentially pathogenic variants and identify shared regions of homozygosity. Immunoblotting assessed protein expression and post-translational modifications in patient-derived fibroblasts. RESULTS: The variant (c.344T>A; p.V115E) is rare and alters a conserved residue in UFSP2. Immunoblotting in patient-derived fibroblasts revealed reduced UFSP2 abundance and increased abundance of UFMylated targets, indicating the variant may impair de-UFMylation rather than UFMylation. Reconstituting patient-derived fibroblasts with wild-type UFSP2 reduced UFMylation marks. Analysis of UFSP2's structure indicated that variants observed in skeletal disorders localize to the catalytic domain, whereas V115 resides in an N-terminal domain possibly involved in substrate binding. CONCLUSION: Different UFSP2 variants cause markedly different diseases, with homozygosity for V115E causing a severe syndrome of neurodevelopmental disability and epilepsy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».