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Enregistrement W3122235366 · doi:10.3389/fphy.2020.602722

Estimating Parameters of Two-Level Individual-Level Models of the COVID-19 Epidemic Using Ensemble Learning Classifiers

2021· article· en· W3122235366 sur OpenAlexaff
Zeyi Liu, Rob Deardon, Yanghui Fu, Tahsin Ferdous, Tony Ware, Qing Cheng

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesChina Scholarship CouncilNatural Science Foundation of Hunan ProvinceChina Postdoctoral Science FoundationNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMarkov chain Monte CarloCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PandemicTransmission (telecommunications)Bayesian probabilityBayesian inferenceInferenceEnsemble learningSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Computer scienceStatistics2019-20 coronavirus outbreakEconometricsMachine learningGeographyArtificial intelligenceMedicineMathematicsVirologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)OutbreakTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ongoing COVID-19 pandemic has led to a serious health crisis, and information obtained from disease transmission models fitted to observed data is needed to inform containment strategies. As the transmission of virus varies from city to city in different countries, we use a two-level individual-level model to analyze the spatiotemporal SARS-CoV-2 spread. However, inference procedures such as Bayesian Markov chain Monte Carlo, which is commonly used to estimate parameters of ILMs, are computationally expensive. In this study, we use trained ensemble learning classifiers to estimate the parameters of two-level ILMs and show that the fitted ILMs can successfully capture the virus transmission among Wuhan and 16 other cities in Hubei province, China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,507
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,080 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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