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Enregistrement W3122349076 · doi:10.1101/2021.01.20.427514

A system to decipher the origins and relationships of all arthropod outgrowths

2021· preprint· en· W3122349076 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversität zu Köln
Mots-clésArthropodBody planContext (archaeology)VertebrateMimicryTheropodaInsect

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Arthropods (insects, “crustaceans”, myriapods, and chelicerates) display a fascinating diversity of ectodermal structures like plates, horns, helmets, knobs, carapaces, mimicry outgrowths, and wings. The origins and relationships of these structures has tantalized researchers for over a century: did these structures arise de novo in each lineage, or do they emerge from shared, ancestral primordia present in some or even all arthropods? One way to begin answering this is to assess the position and context of these structures on arthropod bodies: do these structures emerge from proximal embryonic leg segments that were converted into the body wall, or do they represent dorsal, non-leg-derived structures? Here, the expression of pannier , araucan , and drumstick – genes previously shown to distinguish proximal leg segments in crustaceans and insects – are examined in a chelicerate representative, the tarantula Acanthoscurria . This gene expression comparison, together with over a century of gene functional, morphological, embryological, and paleontological data, suggests that all arthropod leg segments correspond to each other in a one-to-one fashion, but that in many arthropod lineages, the base of the ancestral leg in the embryo flattens and expands to form the body wall of the adult. This would mean that many arthropod outgrowths which appear to stand on the lateral body wall, such as wings, tergal plates, and gin traps, are derived from the ancestral/embryonic leg base, and likely arose from shared, ancestral primordia present on this leg base in all arthropods. The analysis detailed here means that a simple three- or four-gene in situ expression experiment with pannier , araucan , and drumstick can elucidate the homologies of any arthropod ectodermal structure of interest, including beetle horns, treehopper helmets, and more.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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