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Enregistrement W3122595616 · doi:10.1101/2021.01.26.21250409

The genetic architecture of obsessive-compulsive disorder: alleles across the frequency spectrum contribute liability to OCD

2021· preprint· en· W3122595616 sur OpenAlexaff
Behrang Mahjani, Lambertus Klei, Manuel Mattheisen, Matthew Halvorsen, Abraham Reichenberg, Kathryn Roeder, Nancy L. Pedersen, Julia Boberg, Elles de Schipper, Cynthia M. Bulik, Mikael Landén, Bengt T. Fundín, David Mataix‐Cols, Sven Sandin, Christina M. Hultman, James J. Crowley, Joseph D. Buxbaum, Christian Rück, Bernie Devlin, Dorothy E. Grice

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthCenter for Innovative MedicineStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteVetenskapsrådetLundbeckfondenH. Lundbeck A/SBeatrice and Samuel A. Seaver FoundationKlarman Family Foundation
Mots-clésHeritabilityMinor allele frequencySingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenetic architectureMissing heritability problemBiologyGenetic variationAllele frequencyGenome-wide association studyAlleleGenotypeQuantitative trait locusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Obsessive-compulsive disorder (OCD) is known to be substantially heritable; however, the contribution of common genetic variation across the allele frequency spectrum to this heritability remains uncertain. We use two new, homogenous cohorts to estimate heritability of OCD from common genetic variation and contrast results with prior studies. Methods The sample consisted of 2096 Swedish-born individuals diagnosed with OCD and 4609 controls, all genotyped for common genetic variants, specifically >400,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs) with minor allele frequency (MAF) ≥ 0.01. Using genotypes of these SNPs to estimate distant familial relationships among individuals, we estimated heritability of OCD, both overall and partitioned according to MAF bins. Results We estimated narrow-sense heritability of 28% (SE=4%). The estimate was robust, varying only modestly under different models. Contrary to an earlier study, however, SNPs with MAF between 0.01 and 0.05 accounted for 8% of heritability and estimated heritability per bin roughly follows expectations based on a simple model for SNP-based heritability. Conclusions These results indicate that common inherited risk variation (MAF ≥ 0.01) accounts for most of the heritable variation in OCD. SNPs with low MAF contribute meaningfully to the heritability of OCD and the results are consistent with expectation under the “infinitesimal model,” where risk is influenced by a large number of loci across the genome and across MAF bins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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