Identification of Marbling Gene Loci in Commercial Pigs in Canadian Herds
Notice bibliographique
Résumé
We examined the amount of marbling and tested the genome of boars from 5 breeds of Duroc, Iberian, Lacombe, Berkshire and Pietrian that were commercially available for a swine herd in Canada. The marbling was ranked according to the amount of intramuscular fat % obtained in loin chops consisting of the longissimus dorsi muscle. The genetics were analysed by genome wide association study using 80,000 single nuclear polymorphism (SNP) microarrays. Our samples had pork that achieved > 7 % IMF from 110kg animals. Meta-analysis revealed SNP markers that were associated with the highest marbled pork chops on chromosomes 5, 7, and 16. Using the susScr 11.1 map, we determined that the nearest genes were SSNP, Rh glycoprotein and EGFLAM. We tested a sub-population of Duroc sired animals and found a different set of markers close to GRLB and KCNJ3 on chromosomes 8 and 15. Based on our sample, we can achieve pork with good marbling from animals conventionally raised to standard market weights of 110kg. The choice of a good marbling line of pig is not necessarily breed specific.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».