Molecular profiling of advanced pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC): Role of ctDNA.
Notice bibliographique
Résumé
425 Background: Molecular profiling of tumour samples and circulating tumour DNA (ctDNA) may inform treatment of advanced cancer; the role of ctDNA to predict progression-free-survival (PFS) and overall survival (OS) in advanced PDAC is not fully understood. Methods: Eligible patients: those diagnosed with advanced PDAC undergoing molecular profiling [tumour (Foundation Medicine CDx/Caris) or ctDNA (FoundationMedicine Liquid (72 cancer-related genes))]. Baseline patient characteristics and molecular profiling outcomes, including mutant allele frequency (MAF) for pathological alterations were extracted. The primary aim was to assess the impact of presence of ctDNA at time of systemic chemotherapy initiation on PFS and OS. Results: Total of 26 samples (ctDNA 18 samples and 8 tumour samples) from 25 patients diagnosed with advanced PDAC underwent molecular profiling. When the whole population was analysed, the rate of sample analysis failure seemed to be higher when tumour tissue was tested (37.5%) compared to ctDNA (5.56%); p-value 0.072. The overall rate of identification of pathological findings was 72.73%, with 18.18% of patients having targetable findings [EGFRmut (1 patient), KRAS G12C mut (1 patient), FGFR2 fusion (1 patient), RNF43 mut (1 patient)]; these findings impacted treatment management in one patient only (RNF43 mutation; Wnt inhibitor). Variants of unknown significance were identified in 63.64% of samples. Patients with ctDNA analysis at time of palliative chemotherapy initiation (16 samples; 15 patients) were analysed [6 female (40.00%), median age 69.57 years (range 51.61-81.49), metastatic disease (66.67%), 80% first-line (80%), 20% second-line]. Pathological mutations were identified in 9/15 (60.00%) of these patients (KRAS mutation identified in 6/9). After median follow-up of 8.33 months from sample acquisition, 80% and 53.33% of patients had progressed and died, respectively. Median estimated PFS and OS were 5.65 months (95% CI 1.59-8.17) and 7.80 months (95% CI 4.13-not reached). Presence (vs absence) of pathological alterations in ctDNA showed a trend towards shorter PFS (2.91 vs 6.51 months; HR 1.38 (95% CI 0.40-4.77)) and OS (6.12 vs 9.72 months; HR 2.03 (95% CI 0.60-6.82)). Conclusions: This pilot study demonstrates the feasibility of ctDNA analysis in patients with advanced PDAC prior to initiation of palliative therapy. The presence of pathological alterations in ctDNA may prognosticate for worse PFS and OS. Larger studies are required to confirm these findings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».