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Enregistrement W3123633781 · doi:10.1002/cjp2.192

Immune cell infiltrates as prognostic biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma: a systematic review and meta‐analysis

2021· review· en· W3123633781 sur OpenAlexaboutno aff
Andrew J. McGuigan, Helen G. Coleman, R Stephen McCain, Paul J. Kelly, Mark Taylor, Richard Turkington

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology Clinical Research · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRoyal College of Surgeons of EnglandCancer Research UKCancer Focus Northern Ireland
Mots-clésPancreatic ductal adenocarcinomaMeta-analysisMedicineImmune systemPathologyAdenocarcinomaOncologyInternal medicinePancreatic cancerImmunologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immune cell infiltration has been identified as a prognostic biomarker in several cancers. However, no immune based biomarker has yet been validated for use in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). We undertook a systematic review and meta-analysis of immune cell infiltration, measured by immunohistochemistry (IHC), as a prognostic biomarker in PDAC. All other IHC prognostic biomarkers in PDAC were also summarised. MEDLINE, EMBASE and Web of Science were searched between 1998 and 2018. Studies investigating IHC biomarkers and prognosis in PDAC were included. REMARK score and Newcastle-Ottawa scale were used for qualitative analysis. Random-effects meta-analyses were used to pool results, where possible. Twenty-six articles studied immune cell infiltration IHC biomarkers and PDAC prognosis. Meta-analysis found high infiltration with CD4 (hazard ratio [HR] = 0.65, 95% confidence interval [CI] = 0.51-0.83.) and CD8 (HR = 0.68, 95% CI = 0.55-0.84.) T-lymphocytes associated with better disease-free survival. Reduced overall survival was associated with high CD163 (HR = 1.62, 95% CI = 1.03-2.56). Infiltration of CD3, CD20, FoxP3 and CD68 cells, and PD-L1 expression was not prognostic. In total, 708 prognostic biomarkers were identified in 1101 studies. In summary, high CD4 and CD8 infiltration are associated with better disease-free survival in PDAC. Increased CD163 is adversely prognostic. Despite the publication of 708 IHC prognostic biomarkers in PDAC, none has been validated for clinical use. Further research should focus on reproducibility of prognostic biomarkers in PDAC in order to achieve this.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0120,024
Bibliométrie0,0050,008
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,295
Tête enseignante GPT0,541
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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