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Enregistrement W3123669105 · doi:10.1136/gutjnl-2020-323805

Microsatellite instability/mismatch repair deficiency in pancreatic cancers: the same or different?

2021· article· en· W3123669105 sur OpenAlexafffund
Claudio Luchini, Robert C. Grant, Aldo Scarpa, Steven Gallinger

Notice bibliographique

RevueGut · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Friends of Hebrew UniversityAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroPancreatic Cancer Canada Foundation
Mots-clésMicrosatellite instabilityMSH2MSH6PMS2MLH1DNA mismatch repairPembrolizumabCancerPancreatic cancerLynch syndromeMedicineCancer researchOncologyColorectal cancerInternal medicineImmunotherapyBiologyGeneticsMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic cancer frustrates patients, clinicians and scientists. Five-year overall survival is the worst among common cancers, stubbornly remaining below 10%.1 Despite large international efforts offering unprecedented insights into pancreatic cancer biology in the last 10 years,2 patients with pancreatic cancer have not experienced the exciting translational advances in screening and treatment recently observed in other cancers, with few notable exceptions.3 DNA mismatch repair deficiency (MMRD) overlaps with the most important current areas of cancer research: precision therapy, which describes treatments that target specific biological features of cancers, and immunotherapy, which are treatments that unleash the native immune system against cancer. MMRD encompasses germline or somatic defects in MLH1, MSH2, MSH6 and PMS2 , leading to distinctive genome-wide alterations such as microsatellite instability and high tumour mutational burden.4 Pembrolizumab, an immune-checkpoint inhibitor of programmed cell death protein 1, was the first approved cancer therapy with the indication defined by a molecular feature, rather than cancer type.5 Microsatellite instability/defective mismatch repair (MSI/dMMR) has been extensively studied in some cancer types, such as colorectal and endometrial cancer, but little is known about this molecular alteration in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Notably, in 2021, two manuscripts related to this topic have been published in two different issues of Gut . The first paper is by Luchini et al , and represents a systematic review of all published material on MSI/dMMR in PDAC, coupled with a comparative analysis with existing databases, such as the Surveillance, Epidemiology and End Results Program (SEER) and the Cancer Genome Atlas (TCGA) project.6 The second manuscript is by Grant et al , and represents the largest original study on MSI/dMMR PDAC, providing new genomic data on this tumour entity, including mutational and transcriptomic profiles.7 A summary image of recent advances on MSI/dMMR in …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,928

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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