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Enregistrement W3123719184 · doi:10.1101/2020.05.28.122291

Lung cancer models reveal SARS-CoV-2-induced EMT contributes to COVID-19 pathophysiology

2020· preprint· en· W3123719184 sur OpenAlexfundno aff
C. Allison Stewart, Carl M. Gay, Kavya Ramkumar, Kasey R. Cargill, Robert J. Cardnell, Monique B. Nilsson, Simon Heeke, Elizabeth M. Park, Samrat T. Kundu, Lixia Diao, Qi Wang, Li Shen, Yuanxin Xi, Bingnan Zhang, Carminia Maria Della Corte, You-Hong Fan, Kiran Kundu, Boning Gao, Kimberley Avila, Curtis R. Pickering, Faye M. Johnson, Jianjun Zhang, Humam Kadara, John D. Minna, Don L. Gibbons, Jing Wang, John V. Heymach, Lauren A. Byers

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 and healthcare impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteGenentechNational Institutes of HealthSierra OncologyAstellas PharmaEMD SeronoInternational Association for the Study of Lung CancerRibon TherapeuticsCancer Prevention and Research Institute of TexasU.S. Department of DefenseSanofiExelixisKhalifa Bin Zayed Al Nahyan FoundationGlaxoSmithKlineUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterPfizerAstraZenecaEli Lilly and CompanyBristol-Myers Squibb
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PathophysiologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakLung cancerSars virusMedicineCancerVirologyBetacoronavirusCoronavirusPathologyDiseaseInternal medicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract COVID-19 is an infectious disease caused by SARS-CoV-2, which enters host cells via the cell surface proteins ACE2 and TMPRSS2. Using a variety of normal and malignant models and tissues from the aerodigestive and respiratory tracts, we investigated the expression and regulation of ACE2 and TMPRSS2 . We find that ACE2 expression is restricted to a select population of highly epithelial cells. Notably, infection with SARS-CoV-2 in cancer cell lines, bronchial organoids, and patient nasal epithelium, induces metabolic and transcriptional changes consistent with epithelial to mesenchymal transition (EMT), including upregulation of ZEB1 and AXL , resulting in an increased EMT score. Additionally, a transcriptional loss of genes associated with tight junction function occurs with SARS-CoV-2 infection. The SARS-CoV-2 receptor, ACE2, is repressed by EMT via TGFbeta, ZEB1 overexpression and onset of EGFR TKI inhibitor resistance. This suggests a novel model of SARS-CoV-2 pathogenesis in which infected cells shift toward an increasingly mesenchymal state, associated with a loss of tight junction components with acute respiratory distress syndrome-protective effects. AXL-inhibition and ZEB1-reduction, as with bemcentinib, offers a potential strategy to reverse this effect. These observations highlight the utility of aerodigestive and, especially, lung cancer model systems in exploring the pathogenesis of SARS-CoV-2 and other respiratory viruses, and offer important insights into the potential mechanisms underlying the morbidity and mortality of COVID-19 in healthy patients and cancer patients alike.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,177
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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