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Enregistrement W3123890264 · doi:10.1111/nph.17240

Temperature and pH define the realised niche space of arbuscular mycorrhizal fungi

2021· article· en· W3123890264 sur OpenAlexafffund
John Davison, Mari Moora, Marina Semchenko, Sakeenah Adenan, Talaat Ahmed, Asem A. Akhmetzhanova, Juha M. Alatalo, Saleh Al‐Quraishy, E. A. Andrianova, Sten Anslan, Mohammad Bahram, Amgaa Batbaatar, Charlotte Brown, C. Guillermo Bueno, James F. Cahill, Juan José Cantero, Brenda B. Casper, Mikhail Cherosov, Saida Chideh, Ana P. Coelho, Matthew Coghill, Guillaume Decocq, Sergey V. Dudov, Ezequiel Fabiano, Vladimir E. Fedosov, Lauchlan H. Fraser, Sydney I. Glassman, Aveliina Helm, Hugh A. L. Henry, Bruno Hérault, Indrek Hiiesalu, Inga Hiiesalu, Wael N. Hozzein, Petr Kohout, Urmas Kõljalg, Kadri Koorem, Lauri Laanisto, Ülo Mander, Ladislav Mucina, Jean-Pierre Munyampundu, Lena Neuenkamp, Ülo Niinemets, Casper Nyamukondiwa, Jane Oja, В. Г. Онипченко, Meelis Pärtel, Cherdchai Phosri, Sergei Põlme, Kersti Püssa, Argo Ronk, Alessandro Saitta, Olivia Semboli, Siim‐Kaarel Sepp, Alexey P. Seregin, Surya Sudheer, Clara P. Peña‐Venegas, Claudia Paz, Tanel Vahter, Martti Vasar, Annelies J. Veraart, Leho Tedersoo, Martin Zobel, Maarja Öpik

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensWestern UniversityThompson Rivers UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLomonosov Moscow State UniversityTartu ÜlikoolRussian Science FoundationEesti TeadusagentuurVetenskapsrådetQatar PetroleumFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésEcological nicheNicheEcologyBiologyEcosystemBiological dispersalNiche segregationAbundance (ecology)Abiotic componentRelative species abundanceNiche differentiationPhylogenetic treeHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The arbuscular mycorrhizal (AM) fungi are a globally distributed group of soil organisms that play critical roles in ecosystem function. However, the ecological niches of individual AM fungal taxa are poorly understood. We collected > 300 soil samples from natural ecosystems worldwide and modelled the realised niches of AM fungal virtual taxa (VT; approximately species-level phylogroups). We found that environmental and spatial variables jointly explained VT distribution worldwide, with temperature and pH being the most important abiotic drivers, and spatial effects generally occurring at local to regional scales. While dispersal limitation could explain some variation in VT distribution, VT relative abundance was almost exclusively driven by environmental variables. Several environmental and spatial effects on VT distribution and relative abundance were correlated with phylogeny, indicating that closely related VT exhibit similar niche optima and widths. Major clades within the Glomeraceae exhibited distinct niche optima, Acaulosporaceae generally had niche optima in low pH and low temperature conditions, and Gigasporaceae generally had niche optima in high precipitation conditions. Identification of the realised niche space occupied by individual and phylogenetic groups of soil microbial taxa provides a basis for building detailed hypotheses about how soil communities respond to gradients and manipulation in ecosystems worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,624
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations249
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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