High affinity promoter binding of STOP1 is essential for early expression of novel aluminum-induced resistance genes <i>GDH1</i> and <i>GDH2</i> in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
Malate efflux from roots, which is regulated by the transcription factor STOP1 (SENSITIVE-TO-PROTON-RHIZOTOXICITY1) and mediates aluminum-induced expression of ALUMINUM-ACTIVATED-MALATE-TRANSPORTER1 (AtALMT1), is critical for aluminum resistance in Arabidopsis thaliana. Several studies showed that AtALMT1 expression in roots is rapidly observed in response to aluminum; this early induction is an important mechanism to immediately protect roots from aluminum toxicity. Identifying the molecular mechanisms that underlie rapid aluminum resistance responses should lead to a better understanding of plant aluminum sensing and signal transduction mechanisms. In this study, we observed that GFP-tagged STOP1 proteins accumulated in the nucleus soon after aluminum treatment. The rapid aluminum-induced STOP1-nuclear localization and AtALMT1 induction were detected in the presence of a protein synthesis inhibitor, suggesting that post-translational regulation is involved in these events. STOP1 also regulated rapid aluminum-induced expression for other genes that carry a functional/high-affinity STOP1-binding site in their promoter, including STOP2, GLUTAMATE-DEHYDROGENASE1 and 2 (GDH1 and 2). However STOP1 did not regulate Al resistance genes which have no functional STOP1-binding site such as ALUMINUM-SENSITIVE3, suggesting that the binding of STOP1 in the promoter is essential for early induction. Finally, we report that GDH1 and 2 which are targets of STOP1, are novel aluminum-resistance genes in Arabidopsis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».