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Enregistrement W3124079586 · doi:10.1109/tcbb.2021.3053181

An Ensemble Hybrid Feature Selection Method for Neuropsychiatric Disorder Classification

2021· article· en· W3124079586 sur OpenAlexaff
Liangliang Liu, Shaojie Tang, Fang‐Xiang Wu, Yu‐Ping Wang, Jianxin Wang

Notice bibliographique

RevueIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesHigher Education Discipline Innovation ProjectNatural Science Foundation of Hunan ProvinceHunan Provincial Science and Technology DepartmentNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPattern recognition (psychology)Feature selectionArtificial intelligenceFeature (linguistics)Computer sciencePhenomicsFeature extractionEnsemble learningBiologyGenomicsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Magnetic resonance imagings (MRIs) are providing increased access to neuropsychiatric disorders that can be made available for advanced data analysis. However, the single type of data limits the ability of psychiatrists to distinguish the subclasses of this disease. In this paper, we propose an ensemble hybrid features selection method for the neuropsychiatric disorder classification. The method consists of a 3D DenseNet and a XGBoost, which are used to select the image features from structural MRI images and the phenotypic feature from phenotypic records, respectively. The hybrid feature is composed of image features and phenotypic features. The proposed method is validated in the Consortium for Neuropsychiatric Phenomics (CNP) dataset, where samples are classified into one of the four classes (healthy controls (HC), attention deficit hyperactivity disorder (ADHD), bipolar disorder (BD), and schizophrenia (SD)). Experimental results show that the hybrid feature can improve the performance of classification methods. The best accuracy of binary and multi-class classification can reach 91.22 and 78.62 percent, respectively. We analyze the importance of phenotypic features and image features in different classification tasks. The importance of the structure MRI images is highlighted by incorporating phenotypic features with image features to generate hybrid features. We also visualize the features of three neuropsychiatric disorders and analyze their locations in the brain region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,882
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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