Serological and Molecular Characterization of Mycobacterium avium Subsp. paratuberculosis (MAP) from Sheep, Goats, Cattle and Camels in the Eastern Province, Saudi Arabia
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of the present study were to characterize Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) infection using serological and molecular tools and investigate the distribution and molecular characterization of MAP strains (cattle (C) and sheep (S) types) in sheep, goat, cattle, and camel herds in Eastern Province, Saudi Arabia. Serum and fecal samples were collected from all animals aged >2 years old in 31 herds (sheep = 8, goats = 6, cattle = 8 and camels = 9) from January to December 2019. Serum samples were tested by ELISA for the detection of MAP antibodies. Fecal samples were tested by PCR for the detection of MAP IS900 gene and the identification of MAP strains. MAP antibodies were detected in 19 (61.3%) herds. At the animal level, antibodies against MAP were detected in 43 (19.5%) sheep, 21 (17.1%) goats, 13 (19.7%) cattle and 22 (9.1%) camels. The IS900 gene of MAP was detected in 23 (74.2%) herds and was directly amplified from fecal samples of 59 (26.8%) sheep, 34 (27.6%) goats, 20 (30.3%) cattle and 36 (15.0%) camels. The S-type was the most prevalent MAP type identified in 15 herds, and all were identified as type-I, while the C-type was identified in only 8 herds. The IS900 sequences revealed genetic differences among the MAP isolates recovered from sheep, goats, cattle and camels. Results from the present study show that MAP was prevalent and confirm the distribution of different MAP strains in sheep, goat, cattle and camel herds in Eastern Province, Saudi Arabia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».