Morphological and molecular identification of <i>Phytophthora tropicalis</i> causing black pod rot in Mexico
Notice bibliographique
Résumé
Theobroma cacao L. is cultivated in Mexico, primarily in Tabasco, a southern state where the climatic conditions are suitable for producing cacao, the source of chocolate. However, these conditions are also suitable for cacao pathogens such as Phytophthora spp., the causative agents of black pod rot, a disease that is difficult to eradicate once established. In this study, we collected cacao pods exhibiting the symptoms and signs of black pod rot from different locations in Tabasco. Several recovered isolates exhibited the typical colony morphology of Phytophthora, including a white mycelium, stellate with chrysanthemum shape and appressed appearance with slightly torulose hyphae. Both sporangia and chlamydospores were absent in culture media, but were observed after induction in a sterile soil solution. Sporangia were papillated, and the sporangial shapes were globose, ellipsoid, and obturbinate, while the sporangiospores were umbrella shaped and simple sympodial. Chlamydospores were spherical, terminal, and subterminal. The concatenated analysis of the internal transcribed spacer region (ITS1-5.8S-ITS2 = ITS), the cytochrome c oxidase subunit II (COXII), the translation elongation factor 1α (TEF1) and β-tubulin (BT) placed strain PtCa-14 among several P. tropicalis strains, confirming the identity of this species. The pathogenicity tests on pear and peach fruit and cacao pods showed the ability of this oomycete to induce rot. Taken together, these results indicated the presence of P. tropicalis in the Mexican state of Tabasco and demonstrated its ability to cause black pod rot.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».