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Enregistrement W3124518400 · doi:10.1080/07060661.2020.1870003

Morphological and molecular identification of <i>Phytophthora tropicalis</i> causing black pod rot in Mexico

2021· article· en· W3124518400 sur OpenAlexvenueno aff
Belén Chávez‐Ramírez, Nadia Denisse Rodríguez-Velázquez, Mario Eduardo Chávez-Sánchez, María Soledad Vásquez-Murrieta, Minerva Aurora Hernández-Gallegos, José Rodolfo Velázquez-Martínez, Carlos Hugo Avendaño-Arrazate, Paulina Estrada‐de los Santos

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySporangiumChlamydosporeOomycetePhytophthoraBotanyRoot rotMyceliumPhytophthora palmivoraInternal transcribed spacerHyphaHorticultureSporeMicrobiologyRibosomal RNAPathogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Theobroma cacao L. is cultivated in Mexico, primarily in Tabasco, a southern state where the climatic conditions are suitable for producing cacao, the source of chocolate. However, these conditions are also suitable for cacao pathogens such as Phytophthora spp., the causative agents of black pod rot, a disease that is difficult to eradicate once established. In this study, we collected cacao pods exhibiting the symptoms and signs of black pod rot from different locations in Tabasco. Several recovered isolates exhibited the typical colony morphology of Phytophthora, including a white mycelium, stellate with chrysanthemum shape and appressed appearance with slightly torulose hyphae. Both sporangia and chlamydospores were absent in culture media, but were observed after induction in a sterile soil solution. Sporangia were papillated, and the sporangial shapes were globose, ellipsoid, and obturbinate, while the sporangiospores were umbrella shaped and simple sympodial. Chlamydospores were spherical, terminal, and subterminal. The concatenated analysis of the internal transcribed spacer region (ITS1-5.8S-ITS2 = ITS), the cytochrome c oxidase subunit II (COXII), the translation elongation factor 1α (TEF1) and β-tubulin (BT) placed strain PtCa-14 among several P. tropicalis strains, confirming the identity of this species. The pathogenicity tests on pear and peach fruit and cacao pods showed the ability of this oomycete to induce rot. Taken together, these results indicated the presence of P. tropicalis in the Mexican state of Tabasco and demonstrated its ability to cause black pod rot.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,915
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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