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Enregistrement W3124764591 · doi:10.1002/ajmg.a.62086

Sleep phenotype of individuals with autism spectrum disorder bearing mutations in the <scp><i>PER2</i></scp> circadian rhythm gene

2021· article· en· W3124764591 sur OpenAlexafffund
Ny Hoang, Ryan K. C. Yuen, Jennifer Howe, Irene Drmic, Patricia Ambrozewicz, Carolyn Russell, Jacob Vorstman, Shelly K. Weiss, Evdokia Anagnostou, Beth A. Malow, Stephen W. Scherer

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalMcMaster UniversityMcMaster Children's HospitalUniversity of TorontoSickKids FoundationHamilton Health SciencesMcMaster University Medical CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationOntario Genomics InstituteOntario Brain InstituteCanadian Institute for Advanced ResearchGovernment of OntarioAutism Speaks
Mots-clésPER2Circadian rhythmMissense mutationAutism spectrum disorderFree-running sleepPsychologySleep disorderActigraphyDelayed sleep phaseAutismMedicineGeneticsPsychiatryPhenotypeCLOCKNeuroscienceCircadian clockBiologyInsomniaGeneLight effects on circadian rhythm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Per family of genes functions as a primary circadian rhythm maintenance in the brain. Mutations in PER2 are associated with familial advanced sleep-phase syndrome 1 (FASPS1), and recently suggested in delayed sleep phase syndrome and idiopathic hypersomnia. The detection of PER2 variants in individuals with autism spectrum disorder (ASD) and without reported sleep disorders, has suggested a role of circadian-relevant genes in the pathophysiology of ASD. It remains unclear whether these individuals may have, in addition to ASD, an undiagnosed circadian rhythm sleep disorder. The MSSNG database was used to screen whole genome sequencing data of 5,102 individuals with ASD for putative mutations in PER2. Families identified were invited to complete sleep phenotyping consisting of a structured interview and two standardized sleep questionnaires: the Pittsburgh Sleep Quality Index and the Morningness-Eveningness Questionnaire. From 5,102 individuals with ASD, two nonsense, one frameshift, and one de novo missense PER2 variants were identified (0.08%). Of these four, none had a diagnosed sleep disorder. Three reported either a history of, or ongoing sleep disturbances, and one had symptoms highly suggestive of FASPS1 (as did a mutation carrier father without ASD). The individual with the missense variant did not report sleep concerns. The ASD and cognitive profiles of these individuals varied in severity and symptoms. The results support a possible role of PER2-related circadian rhythm disturbances in the dysregulation of sleep overall and sometimes FASPS1. The relationship between dysregulated sleep and the pathophysiology of ASD require further exploration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,227
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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