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Enregistrement W3125239029 · doi:10.1080/22221751.2021.1878937

Saliva viral load better correlates with clinical and immunological profiles in children with coronavirus disease 2019

2021· article· en· W3125239029 sur OpenAlexaff
Gilbert T. Chua, Joshua Sung Chih Wong, Kelvin Kai‐Wang To, Ivan C.S. Lam, Yat Sun Yau, Wai Hung Chan, Polly P.K. Ho, Jaime S. Rosa Duque, Cyril Chik‐Yan Yip, Anthony Chin‐Ki Ng, Wilfred Hing Sang Wong, Joyce H. Y. Kwong, Kate F. S. Leung, P. T. Wan, Kelly Y. C. Lam, Ian Chi Kei Wong, Janette Kwok, M. Ho, Gcf Chan, YL Lau, Patrick Ip, Mike Yat Wah Kwan

Notice bibliographique

RevueEmerging Microbes & Infections · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalivaViral loadAsymptomaticMedicineImmunologySputumViral sheddingGastroenterologyInternal medicineVirusPathologyTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Pediatric COVID-19 studies exploring the relationships between NPS and saliva viral loads, clinical and immunological profiles are lacking.Methods Demographics, immunological profiles, nasopharyngeal swab (NPS), and saliva samples collected on admission, and hospital length of stay (LOS) were assessed in children below 18 years with COVID-19.Findings 91 patients were included between March and August 20 20. NPS and saliva viral loads were correlated (r = 0.315, p = 0.01). Symptomatic patients had significantly higher NPS and saliva viral loads than asymptomatic patients. Serial NPS and saliva viral load measurements showed that the log10 NPS (r = −0.532, p < 0.001) and saliva (r = −0.417, p < 0.001) viral loads for all patients were inversely correlated with the days from symptom onset with statistical significance. Patients with cough, sputum, and headache had significantly higher saliva, but not NPS, viral loads. Higher saliva, but not NPS, viral loads were associated with total lymphopenia, CD3 and CD4 lymphopenia (all p < 0.05), and were inversely correlated with total lymphocyte (r = −0.43), CD3 (r = −0.55), CD4 (r = −0.60), CD8 (r = −0.41), B (r = −0.482), and NK (r = −0.416) lymphocyte counts (all p < 0.05).Interpretation Saliva viral loads on admission in children correlated better with clinical and immunological profiles than NPS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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