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Enregistrement W3125727830 · doi:10.1038/s41467-020-20680-5

White pupae phenotype of tephritids is caused by parallel mutations of a MFS transporter

2021· article· en· W3125727830 sur OpenAlexafffund
Christopher M. Ward, Roswitha A. Aumann, Mark Whitehead, Katerina Nikolouli, Gary Leveque, Georgia Gouvi, Elisabeth Fung, Sarah J. Reiling, Haig Djambazian, Margaret Hughes, Carlos E. Cáceres-Barrios, Thu Nguyen, Amanda Choo, Peter A. Crisp, Sheina B. Sim, Scott M. Geib, František Marec, Irina Häcker, Jiannis Ragoussis, Alistair C. Darby, Kostas Bourtzis, Simon W. Baxter, Marc F. Schetelig

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect behavior and control techniques
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAgricultural Research ServiceInternational Atomic Energy AgencyNational Institute of Food and AgricultureDeutsche ForschungsgemeinschaftHermon Slade FoundationSouth Australian Research and Development InstituteGenome CanadaMacquarie UniversityHort InnovationMcGill UniversityAustralian GovernmentU.S. Department of Agriculture
Mots-clésCeratitis capitataBiologyBactrocera dorsalisSterile insect techniquePhenotypeGeneticsWhite (mutation)GeneCRISPRCapitataInsectMutationTephritidaePEST analysisBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mass releases of sterilized male insects, in the frame of sterile insect technique programs, have helped suppress insect pest populations since the 1950s. In the major horticultural pests Bactrocera dorsalis, Ceratitis capitata, and Zeugodacus cucurbitae, a key phenotype white pupae (wp) has been used for decades to selectively remove females before releases, yet the gene responsible remained unknown. Here, we use classical and modern genetic approaches to identify and functionally characterize causal wp − mutations in these distantly related fruit fly species. We find that the wp phenotype is produced by parallel mutations in a single, conserved gene. CRISPR/Cas9-mediated knockout of the wp gene leads to the rapid generation of white pupae strains in C. capitata and B. tryoni. The conserved phenotype and independent nature of wp − mutations suggest this technique can provide a generic approach to produce sexing strains in other major medical and agricultural insect pests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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