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Enregistrement W3126217956 · doi:10.1101/2021.02.03.429630

Multiple indole glucosinolates and myrosinases defend Arabidopsis against <i>Tetranychus urticae</i> herbivory

2021· preprint· en· W3126217956 sur OpenAlexafffund
Émilie Widemann, Kristie Bruinsma, Brendan Walshe‐Roussel, Repon Kumer Saha, David Letwin, Vladimir Zhurov, Mark A. Bernards, Miodrag Grbić, Vojislava Grbić

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensHealth CanadaWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésTetranychus urticaeArabidopsisJasmonateGlucosinolateBiologyJasmonic acidSpider mitePlant defense against herbivoryArabidopsis thalianaBotanyMutantBiochemistrySalicylic acidMiteGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Arabidopsis defenses against herbivores are regulated by the jasmonate hormonal signaling pathway, which leads to the production of a plethora of defense compounds, including tryptophan-derived metabolites produced through CYP79B2/CYP79B3. Jasmonate signaling and CYP79B2/CYP79B3 limit Arabidopsis infestation by the generalist herbivore two-spotted spider mite, Tetranychus urticae . However, the phytochemicals responsible for Arabidopsis protection against T. urticae are unknown. Here, using Arabidopsis mutants that disrupt metabolic pathways downstream of CYP79B2/CYP79B3, and synthetic indole glucosinolates, we identified phytochemicals involved in the defense against T. urticae . We show that Trp-derived metabolites depending on CYP71A12 and CYP71A13 are not affecting mite herbivory. Instead, the supplementation of cyp79b2 cyp79b3 mutant leaves with the 3-indolylmethyl glucosinolate and its derived metabolites demonstrated that the indole glucosinolate pathway is sufficient to assure CYP79B2/CYP79B3-mediated defenses against T. urticae . We demonstrate that three indole glucosinolates can limit T. urticae herbivory, but that they have to be processed by the myrosinases to hinder T. urticae oviposition. Finally, the supplementation of the mutant myc2 myc3 myc4 with indole glucosinolates indicated that the transcription factors MYC2/MYC3/MYC4 induce additional indole glucosinolate-independent defenses that control T. urticae herbivory. Together, these results reveal the complexity of Arabidopsis defenses against T. urticae that rely on multiple indole glucosinolates, specific myrosinases, and additional MYC2/MYC3/MYC4-dependent defenses. One sentence summary Three indole glucosinolates and the myrosinases TGG1/TGG2 help protect Arabidopsis thaliana against the herbivory of the two-spotted spider mite Tetranychus urticae .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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