Does HPV Subtype Predict Outcomes in Head and Neck Cancers?
Notice bibliographique
Résumé
Background. Recently, reanalysis of The Cancer Genome Atlas study demonstrated that human papillomavirus (HPV) genotypes in head and neck cancers other than HPV-16 have inferior survival to HPV-16-positive tumors. We aimed to examine the association of HPV subtypes and survival in a large cohort of patient samples from our institution. Methods. Fresh frozen primary site biopsy samples were collected either in clinic or at the time of surgery. Patient demographic, staging, and survival data were also collected. Tumors were tested for HPV subtypes by quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Univariable and multivariable analyses were performed using Cox proportional hazards regression. Results. 280 patient biopsy samples were collected between 2011 and 2017. Mean ± standard deviation (SD) age was 61.9 ± 11.1 years and most patients (78%) were male. The majority of cancers were of the oral cavity (60%) or oropharynx (25%) and 30% had HPV-positive disease. Median follow-up was 3.76 years and 96/280 patients (34%) developed recurrences. Patients with p16-positive versus negative disease had significantly improved 5-year overall survival (OS, 77.6% vs. 53.3%; <a:math xmlns:a="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"> <a:mi>p</a:mi> <a:mo>=</a:mo> <a:mn>0.009</a:mn> </a:math> ) and progression-free survival (PFS, 67.3% vs. 41.0%, <c:math xmlns:c="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"> <c:mi>p</c:mi> <c:mo>=</c:mo> <c:mn>0.006</c:mn> </c:math> ). Similarly improved 5-year OS and PFS were observed for patients with HPV-positive versus negative disease (65.0% vs. 55.0%, <e:math xmlns:e="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M3"> <e:mi>p</e:mi> <e:mo>=</e:mo> <e:mn>0.084</e:mn> </e:math> ; 53.3% vs. 43.2%, <g:math xmlns:g="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M4"> <g:mi>p</g:mi> <g:mo>=</g:mo> <g:mn>0.072</g:mn> </g:math> , resp.). Patients with HPV-16 compared to other HPV diseases had worse 5-year OS and PFS (62.1% vs. 88.9%, <i:math xmlns:i="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M5"> <i:mi>p</i:mi> <i:mo>=</i:mo> <i:mn>0.273</i:mn> </i:math> ; 49.0% vs. 88.9%, <k:math xmlns:k="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M6"> <k:mi>p</k:mi> <k:mo>=</k:mo> <k:mn>0.081</k:mn> </k:math> , resp.). Conclusions. In contrast to the data derived from The Cancer Genome Atlas, patients with HPV-16 tumors trended towards decreased PFS and OS compared with tumors driven by other HPV genotypes. Further larger multi-institutional studies are necessary to understand the relationship between other HPV genotypes and survival in head and neck squamous cell carcinomas.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».