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Enregistrement W3126363240 · doi:10.3233/jad-201591

Blinded Clinical Evaluation for Dementia of Alzheimer’s Type Classification Using FDG-PET: A Comparison Between Feature-Engineered and Non-Feature-Engineered Machine Learning Methods

2021· article· en· W3126363240 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensJewish General HospitalSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute on Aging
Mots-clésGeneralizability theoryDementiaSample (material)Clinical trialSample size determinationBlinded study

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Advanced machine learning methods can aid in the identification of dementia risk using neuroimaging-derived features including FDG-PET. However, to enable the translation of these methods and test their usefulness in clinical practice, it is crucial to conduct independent validation on real clinical samples, which has yet to be properly delineated in the current literature. OBJECTIVE: In this paper, we present our efforts to enable such clinical translational through the evaluation and comparison of two machine-learning methods for discrimination between dementia of Alzheimer's type (DAT) and Non-DAT controls. METHODS: FDG-PET-based dementia scores were generated on an independent clinical sample whose clinical diagnosis was blinded to the algorithm designers. A feature-engineered approach (multi-kernel probability classifier) and a non-feature-engineered approach (3D convolutional neural network) were analyzed. Both classifiers were pre-trained on cognitively normal subjects as well as subjects with DAT. These two methods provided a probabilistic dementia score for this previously unseen clinical data. Performance of the algorithms were compared against ground-truth dementia rating assessed by experienced nuclear physicians. RESULTS: Blinded clinical evaluation on both classifiers showed good separation between the cognitively normal subjects and the patients diagnosed with DAT. The non-feature-engineered dementia score showed higher sensitivity among subjects whose diagnosis was in agreement between the machine-learning models, while the feature-engineered approach showed higher specificity in non-consensus cases. CONCLUSION: In this study, we demonstrated blinded evaluation using data from an independent clinical sample for assessing the performance in DAT classification models in a clinical setting. Our results showed good generalizability for two machine-learning approaches, marking an important step for the translation of pre-trained machine-learning models into clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,032
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,067
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,168

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0320,067
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,208
Tête enseignante GPT0,495
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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