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Enregistrement W3126403368 · doi:10.1101/2021.02.05.429940

Protein <i>N</i> -glycosylation is essential for SARS-CoV-2 infection

2021· preprint· en· W3126403368 sur OpenAlexaff
Aitor Casas-Sánchez, Alessandra Romero-Ramirez, Eleanor Hargreaves, Cameron C. Ellis, Brian Grajeda, Igor L. Estevao, Edward I. Patterson, Grant L. Hughes, Igor C. Almeida, Tobias Zech, Álvaro Acosta-Serrano

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésGlycosylationInfectivityGlycanHost (biology)VirologyBiologyN-linked glycosylationCellVirusSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)GlycoproteinChemistryCell biologyBiochemistryMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SARS-CoV-2 extensively N -glycosylates its spike proteins, which are necessary for host cell invasion and the target of both vaccines and immunotherapies. These sugars are predicted to help mediate spike binding to the host receptor by stabilizing its ‘open’ conformation and evading host immunity. Here, we investigated both the essentiality of the host N -glycosylation pathway and SARS-CoV-2 N -glycans for infection. Inhibition of host N -glycosylation using RNAi or FDA-approved drugs reduced virus infectivity, including that of several variants. Under these conditions, cells produced less virions and some completely lost their infectivity. Furthermore, partial deglycosylation of intact virions showed that surface-exposed N -glycans are critical for cell invasion. Altogether, spike N -glycosylation is a targetable pathway with clinical potential for treatment or prevention of COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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