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Enregistrement W3126457643 · doi:10.1161/circgen.120.003183

Pharmacogenomics of the Efficacy and Safety of Colchicine in COLCOT

2021· article· en· W3126457643 sur OpenAlex
Marie‐Pierre Dubé, Marc‐André Legault, Audrey Lemaçon, Louis‐Philippe Lemieux Perreault, René Fouodjio, David D. Waters, Simon Kouz, Fausto J. Pinto, Aldo P. Maggioni, Rafael Díaz, Colin Berry, Wolfgang Köenig, José López‐Sendón, Habib Gamra, Ghassan S. Kiwan, Géraldine Asselin, Sylvie Provost, Amina Barhdadi, Maxine Sun, Mariève Cossette, Lucie Blondeau, Ian Mongrain, Anick Dubois, David Rhainds, Nadia Bouabdallaoui, Michelle Samuel, Simon de Denus, Philippe L. L’Allier, Marie‐Claude Guertin, François Roubille, Jean‐Claude Tardif

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalCegep regional de LanaudiereMontreal Heart InstituteUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBritish Heart Foundation
Mots-clésMedicineHazard ratioPharmacogenomicsMyocardial infarctionInternal medicinePharmacogeneticsGenome-wide association studyImputation (statistics)ColchicineSingle-nucleotide polymorphismPharmacologyConfidence intervalGenotypeGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The randomized, placebo-controlled COLCOT (Colchicine Cardiovascular Outcomes Trial) has shown the benefits of colchicine 0.5 mg daily to lower the rate of ischemic cardiovascular events in patients with a recent myocardial infarction. Here, we conducted a post hoc pharmacogenomic study of COLCOT with the aim to identify genetic predictors of the efficacy and safety of treatment with colchicine. Methods: There were 1522 participants of European ancestry from the COLCOT trial available for the pharmacogenomic study of COLCOT trial. The pharmacogenomic study’s primary cardiovascular end point was defined as for the main trial, as time to first occurrence of cardiovascular death, resuscitated cardiac arrest, myocardial infarction, stroke, or urgent hospitalization for angina requiring coronary revascularization. The safety end point was time to the first report of gastrointestinal events. Patients’ DNA was genotyped using the Illumina Global Screening array followed by imputation. We performed a genome-wide association study in colchicine-treated patients. Results: None of the genetic variants passed the genome-wide association study significance threshold for the primary cardiovascular end point conducted in 702 patients in the colchicine arm who were compliant to medication. The genome-wide association study for gastrointestinal events was conducted in all 767 patients in the colchicine arm and found 2 significant association signals, one with lead variant rs6916345 (hazard ratio, 1.89 [95% CI, 1.52–2.35], P =7.41×10 −9 ) in a locus which colocalizes with Crohn disease, and one with lead variant rs74795203 (hazard ratio, 2.51 [95% CI, 1.82–3.47]; P =2.70×10 −8 ), an intronic variant in gene SEPHS1 . The interaction terms between the genetic variants and treatment with colchicine versus placebo were significant. Conclusions: We found 2 genomic regions associated with gastrointestinal events in patients treated with colchicine. Those findings will benefit from replication to confirm that some patients may have genetic predispositions to lower tolerability of treatment with colchicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,852
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle